Protein–RNA interactions for Protein: P39748

FEN1, Flap endonuclease 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FEN1P39748 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FEN1P39748 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FEN1P39748 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FEN1P39748 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FEN1P39748 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FEN1P39748 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FEN1P39748 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FEN1P39748 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FEN1P39748 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FEN1P39748 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FEN1P39748 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FEN1P39748 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FEN1P39748 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FEN1P39748 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FEN1P39748 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FEN1P39748 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FEN1P39748 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FEN1P39748 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FEN1P39748 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FEN1P39748 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FEN1P39748 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FEN1P39748 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FEN1P39748 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FEN1P39748 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FEN1P39748 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FEN1P39748 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FEN1P39748 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FEN1P39748 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FEN1P39748 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FEN1P39748 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FEN1P39748 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FEN1P39748 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FEN1P39748 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FEN1P39748 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FEN1P39748 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FEN1P39748 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FEN1P39748 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FEN1P39748 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FEN1P39748 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FEN1P39748 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FEN1P39748 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FEN1P39748 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FEN1P39748 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FEN1P39748 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FEN1P39748 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FEN1P39748 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FEN1P39748 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FEN1P39748 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FEN1P39748 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FEN1P39748 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FEN1P39748 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FEN1P39748 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FEN1P39748 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FEN1P39748 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FEN1P39748 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FEN1P39748 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FEN1P39748 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FEN1P39748 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FEN1P39748 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FEN1P39748 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FEN1P39748 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FEN1P39748 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FEN1P39748 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FEN1P39748 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FEN1P39748 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
FEN1P39748 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FEN1P39748 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FEN1P39748 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FEN1P39748 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FEN1P39748 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FEN1P39748 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FEN1P39748 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FEN1P39748 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FEN1P39748 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FEN1P39748 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FEN1P39748 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FEN1P39748 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FEN1P39748 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FEN1P39748 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FEN1P39748 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FEN1P39748 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FEN1P39748 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FEN1P39748 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FEN1P39748 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FEN1P39748 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FEN1P39748 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FEN1P39748 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FEN1P39748 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FEN1P39748 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FEN1P39748 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FEN1P39748 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FEN1P39748 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FEN1P39748 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FEN1P39748 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FEN1P39748 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FEN1P39748 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FEN1P39748 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FEN1P39748 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FEN1P39748 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FEN1P39748 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms