Protein–RNA interactions for Protein: P35680

HNF1B, Hepatocyte nuclear factor 1-beta, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF1BP35680 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
HNF1BP35680 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
HNF1BP35680 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HNF1BP35680 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HNF1BP35680 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HNF1BP35680 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
HNF1BP35680 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HNF1BP35680 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HNF1BP35680 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HNF1BP35680 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
HNF1BP35680 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
HNF1BP35680 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HNF1BP35680 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HNF1BP35680 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HNF1BP35680 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HNF1BP35680 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HNF1BP35680 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HNF1BP35680 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HNF1BP35680 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HNF1BP35680 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HNF1BP35680 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HNF1BP35680 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HNF1BP35680 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HNF1BP35680 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HNF1BP35680 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HNF1BP35680 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HNF1BP35680 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HNF1BP35680 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HNF1BP35680 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HNF1BP35680 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HNF1BP35680 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HNF1BP35680 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HNF1BP35680 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HNF1BP35680 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HNF1BP35680 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HNF1BP35680 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HNF1BP35680 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HNF1BP35680 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HNF1BP35680 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HNF1BP35680 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HNF1BP35680 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HNF1BP35680 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HNF1BP35680 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
HNF1BP35680 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HNF1BP35680 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HNF1BP35680 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HNF1BP35680 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HNF1BP35680 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HNF1BP35680 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HNF1BP35680 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HNF1BP35680 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HNF1BP35680 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HNF1BP35680 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HNF1BP35680 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HNF1BP35680 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HNF1BP35680 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HNF1BP35680 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HNF1BP35680 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HNF1BP35680 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HNF1BP35680 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HNF1BP35680 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HNF1BP35680 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HNF1BP35680 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HNF1BP35680 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HNF1BP35680 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HNF1BP35680 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HNF1BP35680 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HNF1BP35680 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HNF1BP35680 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HNF1BP35680 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HNF1BP35680 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HNF1BP35680 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HNF1BP35680 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HNF1BP35680 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HNF1BP35680 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HNF1BP35680 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HNF1BP35680 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HNF1BP35680 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HNF1BP35680 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HNF1BP35680 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HNF1BP35680 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HNF1BP35680 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HNF1BP35680 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HNF1BP35680 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HNF1BP35680 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HNF1BP35680 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HNF1BP35680 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HNF1BP35680 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HNF1BP35680 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HNF1BP35680 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HNF1BP35680 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HNF1BP35680 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HNF1BP35680 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HNF1BP35680 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HNF1BP35680 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HNF1BP35680 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HNF1BP35680 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HNF1BP35680 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HNF1BP35680 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HNF1BP35680 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms