Protein–RNA interactions for Protein: P35670

ATP7B, Copper-transporting ATPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7BP35670 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
ATP7BP35670 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
ATP7BP35670 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
ATP7BP35670 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
ATP7BP35670 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC34.51■■■■□ 3.11
ATP7BP35670 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
ATP7BP35670 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
ATP7BP35670 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
ATP7BP35670 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
ATP7BP35670 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
ATP7BP35670 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
ATP7BP35670 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
ATP7BP35670 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
ATP7BP35670 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
ATP7BP35670 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC34.49■■■■□ 3.11
ATP7BP35670 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
ATP7BP35670 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
ATP7BP35670 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
ATP7BP35670 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
ATP7BP35670 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
ATP7BP35670 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
ATP7BP35670 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
ATP7BP35670 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
ATP7BP35670 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
ATP7BP35670 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
ATP7BP35670 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
ATP7BP35670 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.1
ATP7BP35670 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
ATP7BP35670 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
ATP7BP35670 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
ATP7BP35670 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
ATP7BP35670 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
ATP7BP35670 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
ATP7BP35670 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
ATP7BP35670 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
ATP7BP35670 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
ATP7BP35670 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
ATP7BP35670 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
ATP7BP35670 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
ATP7BP35670 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
ATP7BP35670 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
ATP7BP35670 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
ATP7BP35670 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
ATP7BP35670 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
ATP7BP35670 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
ATP7BP35670 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
ATP7BP35670 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
ATP7BP35670 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
ATP7BP35670 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
ATP7BP35670 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
ATP7BP35670 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
ATP7BP35670 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
ATP7BP35670 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
ATP7BP35670 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
ATP7BP35670 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
ATP7BP35670 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
ATP7BP35670 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
ATP7BP35670 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
ATP7BP35670 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
ATP7BP35670 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC34.33■■■■□ 3.09
ATP7BP35670 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
ATP7BP35670 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
ATP7BP35670 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
ATP7BP35670 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
ATP7BP35670 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
ATP7BP35670 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
ATP7BP35670 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
ATP7BP35670 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC34.3■■■■□ 3.08
ATP7BP35670 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC34.3■■■■□ 3.08
ATP7BP35670 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
ATP7BP35670 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
ATP7BP35670 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
ATP7BP35670 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
ATP7BP35670 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
ATP7BP35670 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC34.29■■■■□ 3.08
ATP7BP35670 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
ATP7BP35670 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
ATP7BP35670 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
ATP7BP35670 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
ATP7BP35670 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
ATP7BP35670 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
ATP7BP35670 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
ATP7BP35670 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
ATP7BP35670 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
ATP7BP35670 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
ATP7BP35670 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
ATP7BP35670 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
ATP7BP35670 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.07
ATP7BP35670 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
ATP7BP35670 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
ATP7BP35670 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
ATP7BP35670 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
ATP7BP35670 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
ATP7BP35670 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
ATP7BP35670 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ATP7BP35670 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ATP7BP35670 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ATP7BP35670 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ATP7BP35670 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
ATP7BP35670 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms