Protein–RNA interactions for Protein: P35658

NUP214, Nuclear pore complex protein Nup214, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP214P35658 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP214P35658 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP214P35658 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP214P35658 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP214P35658 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP214P35658 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP214P35658 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP214P35658 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP214P35658 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP214P35658 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP214P35658 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP214P35658 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP214P35658 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP214P35658 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP214P35658 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP214P35658 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP214P35658 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP214P35658 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP214P35658 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NUP214P35658 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP214P35658 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP214P35658 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP214P35658 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP214P35658 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP214P35658 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP214P35658 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP214P35658 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP214P35658 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP214P35658 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP214P35658 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP214P35658 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP214P35658 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP214P35658 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP214P35658 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP214P35658 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP214P35658 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP214P35658 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP214P35658 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP214P35658 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP214P35658 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP214P35658 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP214P35658 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP214P35658 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP214P35658 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP214P35658 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP214P35658 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP214P35658 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP214P35658 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP214P35658 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUP214P35658 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUP214P35658 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUP214P35658 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUP214P35658 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP214P35658 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP214P35658 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP214P35658 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP214P35658 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP214P35658 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP214P35658 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP214P35658 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP214P35658 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP214P35658 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP214P35658 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP214P35658 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP214P35658 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP214P35658 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP214P35658 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP214P35658 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP214P35658 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP214P35658 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP214P35658 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP214P35658 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP214P35658 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP214P35658 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP214P35658 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP214P35658 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP214P35658 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP214P35658 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP214P35658 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
NUP214P35658 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
NUP214P35658 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
NUP214P35658 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NUP214P35658 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NUP214P35658 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUP214P35658 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUP214P35658 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUP214P35658 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUP214P35658 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NUP214P35658 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUP214P35658 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUP214P35658 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUP214P35658 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUP214P35658 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP214P35658 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP214P35658 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP214P35658 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP214P35658 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP214P35658 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUP214P35658 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUP214P35658 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms