Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTNNA1P35221 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTNNA1P35221 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CTNNA1P35221 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CTNNA1P35221 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTNNA1P35221 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTNNA1P35221 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTNNA1P35221 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTNNA1P35221 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTNNA1P35221 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTNNA1P35221 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTNNA1P35221 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTNNA1P35221 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CTNNA1P35221 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CTNNA1P35221 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CTNNA1P35221 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CTNNA1P35221 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CTNNA1P35221 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CTNNA1P35221 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CTNNA1P35221 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTNNA1P35221 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CTNNA1P35221 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTNNA1P35221 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTNNA1P35221 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTNNA1P35221 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTNNA1P35221 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CTNNA1P35221 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CTNNA1P35221 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CTNNA1P35221 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CTNNA1P35221 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CTNNA1P35221 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CTNNA1P35221 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTNNA1P35221 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTNNA1P35221 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTNNA1P35221 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CTNNA1P35221 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTNNA1P35221 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTNNA1P35221 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTNNA1P35221 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTNNA1P35221 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTNNA1P35221 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTNNA1P35221 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTNNA1P35221 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTNNA1P35221 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTNNA1P35221 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTNNA1P35221 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTNNA1P35221 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTNNA1P35221 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTNNA1P35221 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTNNA1P35221 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTNNA1P35221 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTNNA1P35221 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTNNA1P35221 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTNNA1P35221 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CTNNA1P35221 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CTNNA1P35221 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CTNNA1P35221 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTNNA1P35221 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTNNA1P35221 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTNNA1P35221 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTNNA1P35221 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTNNA1P35221 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTNNA1P35221 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTNNA1P35221 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTNNA1P35221 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTNNA1P35221 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTNNA1P35221 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTNNA1P35221 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTNNA1P35221 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTNNA1P35221 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTNNA1P35221 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTNNA1P35221 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTNNA1P35221 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTNNA1P35221 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTNNA1P35221 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTNNA1P35221 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTNNA1P35221 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTNNA1P35221 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTNNA1P35221 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTNNA1P35221 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CTNNA1P35221 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTNNA1P35221 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTNNA1P35221 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTNNA1P35221 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTNNA1P35221 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTNNA1P35221 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTNNA1P35221 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTNNA1P35221 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTNNA1P35221 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTNNA1P35221 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTNNA1P35221 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTNNA1P35221 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTNNA1P35221 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTNNA1P35221 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTNNA1P35221 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTNNA1P35221 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTNNA1P35221 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTNNA1P35221 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTNNA1P35221 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTNNA1P35221 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms