Protein–RNA interactions for Protein: P34741

SDC2, Syndecan-2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDC2P34741 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDC2P34741 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDC2P34741 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDC2P34741 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SDC2P34741 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SDC2P34741 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SDC2P34741 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SDC2P34741 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SDC2P34741 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SDC2P34741 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SDC2P34741 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SDC2P34741 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SDC2P34741 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SDC2P34741 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SDC2P34741 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SDC2P34741 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SDC2P34741 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SDC2P34741 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SDC2P34741 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SDC2P34741 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SDC2P34741 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SDC2P34741 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SDC2P34741 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SDC2P34741 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SDC2P34741 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SDC2P34741 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SDC2P34741 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SDC2P34741 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SDC2P34741 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SDC2P34741 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SDC2P34741 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SDC2P34741 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SDC2P34741 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SDC2P34741 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SDC2P34741 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SDC2P34741 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SDC2P34741 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SDC2P34741 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SDC2P34741 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SDC2P34741 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SDC2P34741 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SDC2P34741 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SDC2P34741 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SDC2P34741 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SDC2P34741 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SDC2P34741 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SDC2P34741 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SDC2P34741 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SDC2P34741 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SDC2P34741 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SDC2P34741 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SDC2P34741 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SDC2P34741 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SDC2P34741 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SDC2P34741 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SDC2P34741 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SDC2P34741 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SDC2P34741 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SDC2P34741 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SDC2P34741 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SDC2P34741 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SDC2P34741 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SDC2P34741 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SDC2P34741 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SDC2P34741 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SDC2P34741 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SDC2P34741 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SDC2P34741 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SDC2P34741 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SDC2P34741 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SDC2P34741 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SDC2P34741 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SDC2P34741 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SDC2P34741 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SDC2P34741 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SDC2P34741 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SDC2P34741 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SDC2P34741 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SDC2P34741 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SDC2P34741 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SDC2P34741 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SDC2P34741 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SDC2P34741 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SDC2P34741 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SDC2P34741 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SDC2P34741 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SDC2P34741 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SDC2P34741 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDC2P34741 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDC2P34741 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDC2P34741 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDC2P34741 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDC2P34741 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDC2P34741 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SDC2P34741 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SDC2P34741 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SDC2P34741 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SDC2P34741 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SDC2P34741 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SDC2P34741 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms