Protein–RNA interactions for Protein: P33991

MCM4, DNA replication licensing factor MCM4, humanhuman

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM4P33991 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
MCM4P33991 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
MCM4P33991 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
MCM4P33991 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MCM4P33991 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MCM4P33991 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MCM4P33991 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MCM4P33991 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MCM4P33991 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MCM4P33991 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MCM4P33991 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
MCM4P33991 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
MCM4P33991 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
MCM4P33991 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
MCM4P33991 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
MCM4P33991 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MCM4P33991 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MCM4P33991 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
MCM4P33991 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MCM4P33991 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MCM4P33991 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MCM4P33991 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MCM4P33991 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MCM4P33991 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MCM4P33991 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MCM4P33991 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MCM4P33991 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MCM4P33991 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MCM4P33991 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MCM4P33991 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MCM4P33991 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MCM4P33991 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
MCM4P33991 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MCM4P33991 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MCM4P33991 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MCM4P33991 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MCM4P33991 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
MCM4P33991 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MCM4P33991 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MCM4P33991 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MCM4P33991 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MCM4P33991 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MCM4P33991 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MCM4P33991 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MCM4P33991 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
MCM4P33991 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
MCM4P33991 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
MCM4P33991 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MCM4P33991 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MCM4P33991 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MCM4P33991 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MCM4P33991 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MCM4P33991 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MCM4P33991 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MCM4P33991 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MCM4P33991 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MCM4P33991 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MCM4P33991 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MCM4P33991 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MCM4P33991 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MCM4P33991 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MCM4P33991 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MCM4P33991 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MCM4P33991 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MCM4P33991 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MCM4P33991 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MCM4P33991 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MCM4P33991 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MCM4P33991 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MCM4P33991 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
MCM4P33991 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MCM4P33991 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MCM4P33991 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MCM4P33991 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MCM4P33991 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MCM4P33991 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MCM4P33991 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MCM4P33991 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MCM4P33991 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MCM4P33991 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MCM4P33991 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MCM4P33991 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MCM4P33991 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MCM4P33991 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MCM4P33991 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MCM4P33991 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MCM4P33991 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MCM4P33991 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MCM4P33991 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MCM4P33991 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MCM4P33991 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MCM4P33991 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MCM4P33991 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MCM4P33991 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MCM4P33991 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MCM4P33991 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MCM4P33991 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MCM4P33991 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MCM4P33991 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MCM4P33991 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms