Protein–RNA interactions for Protein: P31644

GABRA5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA5P31644 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABRA5P31644 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GABRA5P31644 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABRA5P31644 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABRA5P31644 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABRA5P31644 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABRA5P31644 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABRA5P31644 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABRA5P31644 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABRA5P31644 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABRA5P31644 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABRA5P31644 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABRA5P31644 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GABRA5P31644 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GABRA5P31644 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GABRA5P31644 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GABRA5P31644 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GABRA5P31644 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GABRA5P31644 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GABRA5P31644 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GABRA5P31644 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GABRA5P31644 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GABRA5P31644 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GABRA5P31644 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GABRA5P31644 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GABRA5P31644 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABRA5P31644 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABRA5P31644 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABRA5P31644 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABRA5P31644 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABRA5P31644 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABRA5P31644 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABRA5P31644 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABRA5P31644 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GABRA5P31644 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GABRA5P31644 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GABRA5P31644 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GABRA5P31644 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GABRA5P31644 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GABRA5P31644 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABRA5P31644 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABRA5P31644 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABRA5P31644 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABRA5P31644 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABRA5P31644 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABRA5P31644 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABRA5P31644 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABRA5P31644 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABRA5P31644 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABRA5P31644 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABRA5P31644 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABRA5P31644 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABRA5P31644 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABRA5P31644 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABRA5P31644 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABRA5P31644 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GABRA5P31644 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GABRA5P31644 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GABRA5P31644 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GABRA5P31644 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABRA5P31644 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABRA5P31644 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABRA5P31644 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABRA5P31644 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABRA5P31644 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABRA5P31644 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABRA5P31644 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABRA5P31644 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABRA5P31644 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABRA5P31644 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
GABRA5P31644 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GABRA5P31644 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABRA5P31644 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABRA5P31644 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GABRA5P31644 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABRA5P31644 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABRA5P31644 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABRA5P31644 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABRA5P31644 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABRA5P31644 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABRA5P31644 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABRA5P31644 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABRA5P31644 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABRA5P31644 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABRA5P31644 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABRA5P31644 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABRA5P31644 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABRA5P31644 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABRA5P31644 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABRA5P31644 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABRA5P31644 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABRA5P31644 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABRA5P31644 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABRA5P31644 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GABRA5P31644 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GABRA5P31644 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GABRA5P31644 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GABRA5P31644 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GABRA5P31644 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GABRA5P31644 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms