Protein–RNA interactions for Protein: P31040

SDHA, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAP31040 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDHAP31040 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDHAP31040 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDHAP31040 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDHAP31040 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDHAP31040 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDHAP31040 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDHAP31040 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDHAP31040 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDHAP31040 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDHAP31040 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDHAP31040 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDHAP31040 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDHAP31040 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDHAP31040 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDHAP31040 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDHAP31040 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDHAP31040 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDHAP31040 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SDHAP31040 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDHAP31040 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SDHAP31040 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SDHAP31040 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SDHAP31040 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDHAP31040 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDHAP31040 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDHAP31040 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDHAP31040 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SDHAP31040 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SDHAP31040 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SDHAP31040 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDHAP31040 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDHAP31040 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDHAP31040 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDHAP31040 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDHAP31040 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDHAP31040 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDHAP31040 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDHAP31040 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDHAP31040 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDHAP31040 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDHAP31040 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDHAP31040 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDHAP31040 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDHAP31040 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDHAP31040 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDHAP31040 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SDHAP31040 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDHAP31040 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDHAP31040 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDHAP31040 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDHAP31040 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SDHAP31040 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDHAP31040 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDHAP31040 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDHAP31040 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDHAP31040 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDHAP31040 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SDHAP31040 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDHAP31040 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SDHAP31040 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDHAP31040 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDHAP31040 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SDHAP31040 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SDHAP31040 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDHAP31040 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDHAP31040 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDHAP31040 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDHAP31040 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDHAP31040 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDHAP31040 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDHAP31040 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDHAP31040 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SDHAP31040 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDHAP31040 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDHAP31040 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDHAP31040 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDHAP31040 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDHAP31040 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDHAP31040 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDHAP31040 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDHAP31040 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDHAP31040 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDHAP31040 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDHAP31040 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDHAP31040 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDHAP31040 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDHAP31040 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDHAP31040 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDHAP31040 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDHAP31040 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDHAP31040 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDHAP31040 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDHAP31040 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDHAP31040 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDHAP31040 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDHAP31040 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDHAP31040 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDHAP31040 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDHAP31040 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms