Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GJB2P29033 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GJB2P29033 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GJB2P29033 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
GJB2P29033 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GJB2P29033 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GJB2P29033 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GJB2P29033 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GJB2P29033 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
GJB2P29033 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GJB2P29033 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GJB2P29033 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GJB2P29033 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GJB2P29033 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GJB2P29033 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GJB2P29033 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GJB2P29033 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
GJB2P29033 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GJB2P29033 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GJB2P29033 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GJB2P29033 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GJB2P29033 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GJB2P29033 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GJB2P29033 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GJB2P29033 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GJB2P29033 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GJB2P29033 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GJB2P29033 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GJB2P29033 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GJB2P29033 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GJB2P29033 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GJB2P29033 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GJB2P29033 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GJB2P29033 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GJB2P29033 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GJB2P29033 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GJB2P29033 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GJB2P29033 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GJB2P29033 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
GJB2P29033 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
GJB2P29033 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GJB2P29033 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GJB2P29033 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
GJB2P29033 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
GJB2P29033 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
GJB2P29033 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
GJB2P29033 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
GJB2P29033 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
GJB2P29033 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
GJB2P29033 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
GJB2P29033 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
GJB2P29033 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GJB2P29033 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GJB2P29033 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GJB2P29033 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GJB2P29033 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GJB2P29033 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GJB2P29033 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GJB2P29033 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GJB2P29033 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GJB2P29033 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GJB2P29033 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GJB2P29033 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
GJB2P29033 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GJB2P29033 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GJB2P29033 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GJB2P29033 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GJB2P29033 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GJB2P29033 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GJB2P29033 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GJB2P29033 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GJB2P29033 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GJB2P29033 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GJB2P29033 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GJB2P29033 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GJB2P29033 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GJB2P29033 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GJB2P29033 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GJB2P29033 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GJB2P29033 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GJB2P29033 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GJB2P29033 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GJB2P29033 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GJB2P29033 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GJB2P29033 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GJB2P29033 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GJB2P29033 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GJB2P29033 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GJB2P29033 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
GJB2P29033 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
GJB2P29033 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
GJB2P29033 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GJB2P29033 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GJB2P29033 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GJB2P29033 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GJB2P29033 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
GJB2P29033 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
GJB2P29033 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
GJB2P29033 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GJB2P29033 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.5 ms