Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GABRB3P28472 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GABRB3P28472 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GABRB3P28472 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GABRB3P28472 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GABRB3P28472 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GABRB3P28472 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GABRB3P28472 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GABRB3P28472 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GABRB3P28472 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GABRB3P28472 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GABRB3P28472 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GABRB3P28472 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GABRB3P28472 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GABRB3P28472 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GABRB3P28472 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GABRB3P28472 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GABRB3P28472 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GABRB3P28472 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GABRB3P28472 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GABRB3P28472 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GABRB3P28472 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GABRB3P28472 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GABRB3P28472 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GABRB3P28472 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GABRB3P28472 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GABRB3P28472 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GABRB3P28472 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GABRB3P28472 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GABRB3P28472 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GABRB3P28472 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GABRB3P28472 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GABRB3P28472 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GABRB3P28472 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GABRB3P28472 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GABRB3P28472 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GABRB3P28472 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GABRB3P28472 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GABRB3P28472 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GABRB3P28472 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GABRB3P28472 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GABRB3P28472 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GABRB3P28472 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GABRB3P28472 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GABRB3P28472 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GABRB3P28472 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GABRB3P28472 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GABRB3P28472 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GABRB3P28472 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GABRB3P28472 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GABRB3P28472 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GABRB3P28472 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GABRB3P28472 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GABRB3P28472 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GABRB3P28472 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GABRB3P28472 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GABRB3P28472 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GABRB3P28472 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GABRB3P28472 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GABRB3P28472 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GABRB3P28472 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GABRB3P28472 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GABRB3P28472 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GABRB3P28472 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GABRB3P28472 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GABRB3P28472 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GABRB3P28472 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GABRB3P28472 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GABRB3P28472 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GABRB3P28472 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GABRB3P28472 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GABRB3P28472 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GABRB3P28472 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GABRB3P28472 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GABRB3P28472 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GABRB3P28472 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GABRB3P28472 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GABRB3P28472 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GABRB3P28472 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GABRB3P28472 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GABRB3P28472 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GABRB3P28472 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GABRB3P28472 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GABRB3P28472 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GABRB3P28472 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GABRB3P28472 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GABRB3P28472 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GABRB3P28472 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GABRB3P28472 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GABRB3P28472 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GABRB3P28472 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GABRB3P28472 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GABRB3P28472 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GABRB3P28472 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GABRB3P28472 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GABRB3P28472 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GABRB3P28472 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GABRB3P28472 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GABRB3P28472 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GABRB3P28472 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms