Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
DNMT1P26358 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
DNMT1P26358 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
DNMT1P26358 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
DNMT1P26358 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
DNMT1P26358 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
DNMT1P26358 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
DNMT1P26358 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
DNMT1P26358 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
DNMT1P26358 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
DNMT1P26358 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
DNMT1P26358 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
DNMT1P26358 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
DNMT1P26358 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC37.61■■■■□ 3.61
DNMT1P26358 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
DNMT1P26358 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
DNMT1P26358 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
DNMT1P26358 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
DNMT1P26358 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
DNMT1P26358 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC37.6■■■■□ 3.61
DNMT1P26358 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
DNMT1P26358 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
DNMT1P26358 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
DNMT1P26358 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
DNMT1P26358 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
DNMT1P26358 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
DNMT1P26358 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
DNMT1P26358 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC37.58■■■■□ 3.61
DNMT1P26358 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
DNMT1P26358 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
DNMT1P26358 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
DNMT1P26358 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC37.57■■■■□ 3.61
DNMT1P26358 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
DNMT1P26358 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC37.57■■■■□ 3.6
DNMT1P26358 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
DNMT1P26358 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
DNMT1P26358 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC37.57■■■■□ 3.6
DNMT1P26358 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
DNMT1P26358 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
DNMT1P26358 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
DNMT1P26358 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC37.55■■■■□ 3.6
DNMT1P26358 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
DNMT1P26358 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
DNMT1P26358 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
DNMT1P26358 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
DNMT1P26358 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
DNMT1P26358 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
DNMT1P26358 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
DNMT1P26358 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
DNMT1P26358 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
DNMT1P26358 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC37.51■■■■□ 3.6
DNMT1P26358 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
DNMT1P26358 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC37.51■■■■□ 3.6
DNMT1P26358 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
DNMT1P26358 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
DNMT1P26358 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC37.5■■■■□ 3.59
DNMT1P26358 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
DNMT1P26358 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
DNMT1P26358 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
DNMT1P26358 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
DNMT1P26358 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
DNMT1P26358 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
DNMT1P26358 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
DNMT1P26358 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC37.48■■■■□ 3.59
DNMT1P26358 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
DNMT1P26358 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
DNMT1P26358 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC37.47■■■■□ 3.59
DNMT1P26358 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
DNMT1P26358 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.47■■■■□ 3.59
DNMT1P26358 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
DNMT1P26358 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
DNMT1P26358 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
DNMT1P26358 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
DNMT1P26358 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
DNMT1P26358 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
DNMT1P26358 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
DNMT1P26358 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
DNMT1P26358 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
DNMT1P26358 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
DNMT1P26358 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
DNMT1P26358 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.58
DNMT1P26358 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
DNMT1P26358 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
DNMT1P26358 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
DNMT1P26358 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
DNMT1P26358 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
DNMT1P26358 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
DNMT1P26358 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
DNMT1P26358 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
DNMT1P26358 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
DNMT1P26358 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
DNMT1P26358 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
DNMT1P26358 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
DNMT1P26358 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
DNMT1P26358 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
DNMT1P26358 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
DNMT1P26358 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
DNMT1P26358 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
DNMT1P26358 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
DNMT1P26358 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms