Protein–RNA interactions for Protein: P26196

DDX6, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX6, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX6P26196 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.075e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.085e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 EIF5-216ENST00000560877 521 ntTSL 414.56□□□□□ -0.085e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.085e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.085e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 ANKRD11-213ENST00000567736 2750 ntTSL 214.53□□□□□ -0.085e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.095e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 ELMSAN1-203ENST00000421708 558 ntTSL 414.4□□□□□ -0.15e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 TCF3-218ENST00000593064 2694 ntTSL 214.39□□□□□ -0.113e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 WDR4-205ENST00000476326 1977 ntTSL 1 (best)14.36□□□□□ -0.115e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 SERPINA5-202ENST00000553511 574 ntTSL 214.35□□□□□ -0.115e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 AC090004.1-201ENST00000608606 653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.125e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.135e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 EIF5-204ENST00000558316 719 ntTSL 314.22□□□□□ -0.135e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 SERPINA5-209ENST00000555681 618 ntTSL 214.22□□□□□ -0.135e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.135e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 WIPF2-206ENST00000582781 3163 ntTSL 1 (best)14.19□□□□□ -0.145e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 PLEKHA7-206ENST00000525781 2391 ntTSL 214.17□□□□□ -0.145e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 PEX5-214ENST00000541850 386 ntTSL 314.12□□□□□ -0.155e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.158e-7■■■■■ 46.6
DDX6P26196 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.152e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.155e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 C11orf58-202ENST00000524439 405 ntTSL 314.04□□□□□ -0.165e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 THEM6-203ENST00000520217 551 ntTSL 314.03□□□□□ -0.165e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 YIPF6-202ENST00000374643 734 ntTSL 313.99□□□□□ -0.175e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 C11orf58-207ENST00000525684 575 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.175e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 C11orf58-209ENST00000528634 776 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.175e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 QTRT1-212ENST00000592531 370 ntTSL 213.94□□□□□ -0.185e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 TCF7-213ENST00000519165 1137 ntTSL 213.91□□□□□ -0.185e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.185e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.184e-11■■■■■ 46.6
DDX6P26196 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.195e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 C11orf58-206ENST00000525256 762 ntTSL 213.85□□□□□ -0.195e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.195e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 AC026461.1-201ENST00000567563 551 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.27e-8■■■■■ 46.6
DDX6P26196 SETDB1-211ENST00000487584 558 ntTSL 413.83□□□□□ -0.25e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 DLGAP4-AS1-203ENST00000439595 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.215e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.225e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 ZNF384-204ENST00000396801 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.235e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 NCOR2-215ENST00000458234 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)13.64□□□□□ -0.235e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.235e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 NR1I2-206ENST00000638727 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.235e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.245e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.245e-7■■■■■ 46.6
DDX6P26196 ANKRD11-202ENST00000330736 8342 ntTSL 513.52□□□□□ -0.255e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 ELMSAN1-205ENST00000435371 3839 ntTSL 1 (best)13.5□□□□□ -0.251e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.255e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 TRPV1-201ENST00000310522 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.255e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 SETDB1-202ENST00000368962 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.255e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 DCTD-207ENST00000507543 1874 ntTSL 513.43□□□□□ -0.265e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 FBLN1-208ENST00000442170 2531 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.265e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.265e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 AC073610.2-201ENST00000537495 406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.279e-9■■■■■ 46.6
DDX6P26196 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.272e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.275e-7■■■■■ 46.6
DDX6P26196 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.275e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.285e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 SETDB1-207ENST00000448029 668 ntTSL 513.3□□□□□ -0.285e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 FBLN1-217ENST00000476366 872 ntTSL 513.28□□□□□ -0.285e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 NCOR2-224ENST00000542927 828 ntTSL 313.26□□□□□ -0.295e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 ANKRD11-206ENST00000562275 2762 ntTSL 513.22□□□□□ -0.295e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.295e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.35e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.32e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.315e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.315e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 C14orf159-205ENST00000517306 2294 ntTSL 1 (best)13.1□□□□□ -0.315e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 PEX5-201ENST00000266563 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.325e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.335e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 NR1I2-207ENST00000640105 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.335e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.335e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 DIAPH1-205ENST00000448451 2102 ntTSL 212.97□□□□□ -0.335e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 YIPF6-201ENST00000374622 6134 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.345e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.355e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 AL359915.1-201ENST00000457719 898 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.355e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 TCF3-220ENST00000611869 4409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.365e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 PEF1-202ENST00000461006 732 ntTSL 512.79□□□□□ -0.365e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.365e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 SETD1B-204ENST00000619791 5901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.375e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.375e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 GPR107-208ENST00000610997 2813 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.375e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 CADM1-221ENST00000612235 1042 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.375e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 CCDC88C-204ENST00000389857 7474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.385e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 CTNNBL1-203ENST00000373473 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.385e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 ZNF384-203ENST00000361959 2978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.385e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 SUCO-209ENST00000610051 2925 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.385e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 TRPV1-209ENST00000576351 2525 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.385e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 TCF3-202ENST00000344749 4289 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.395e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 AL669831.3-208ENST00000634337 891 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.48e-7■■■■■ 46.6
DDX6P26196 PCNA-201ENST00000379143 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.45e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 PATZ1-206ENST00000494109 835 ntTSL 212.52□□□□□ -0.415e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 MDH1-213ENST00000485781 893 ntTSL 212.47□□□□□ -0.415e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 STX1A-206ENST00000462135 568 ntTSL 312.45□□□□□ -0.425e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 SYNM-203ENST00000560674 5908 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.425e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 SPTBN1-203ENST00000389980 2164 ntTSL 1 (best)12.37□□□□□ -0.435e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 ANKRD11-207ENST00000562816 573 ntTSL 412.33□□□□□ -0.445e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 FBLN1-203ENST00000340923 2348 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.445e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 ARF3-201ENST00000256682 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.445e-7■■■■■ 46.6
DDX6P26196 CCDC88C-208ENST00000554165 420 ntTSL 312.26□□□□□ -0.455e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 SIN3A-202ENST00000394947 6737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.465e-6■■■■■ 46.6
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