Protein–RNA interactions for Protein: P25364

HCM1, Forkhead transcription factor HCM1, yeastyeast

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HCM1P25364 HXT13YEL069C 1695 nt7.05□□□□□ -1.28
HCM1P25364 MAS1YLR163C 1389 nt7.05□□□□□ -1.28
HCM1P25364 YNL040WYNL040W 1371 nt7.05□□□□□ -1.28
HCM1P25364 ALG7YBR243C 1347 nt7.04□□□□□ -1.28
HCM1P25364 CIA1YDR267C 993 nt7.04□□□□□ -1.28
HCM1P25364 YEL075W-AYEL075W-A 612 nt7.03□□□□□ -1.28
HCM1P25364 LCL3YGL085W 825 nt7.03□□□□□ -1.28
HCM1P25364 YLR463CYLR463C 552 nt7.03□□□□□ -1.28
HCM1P25364 FMP40YPL222W 2067 nt7.03□□□□□ -1.28
HCM1P25364 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt7.02□□□□□ -1.29
HCM1P25364 MRS3YJL133W 945 nt7.02□□□□□ -1.29
HCM1P25364 TAF4YMR005W 1167 nt7.02□□□□□ -1.29
HCM1P25364 POB3YML069W 1659 nt7.02□□□□□ -1.29
HCM1P25364 AIR1YIL079C 1083 nt7.01□□□□□ -1.29
HCM1P25364 RSC9YML127W 1746 nt7.01□□□□□ -1.29
HCM1P25364 PDC5YLR134W 1692 nt7□□□□□ -1.29
HCM1P25364 CIT2YCR005C 1383 nt7□□□□□ -1.29
HCM1P25364 KTR4YBR199W 1395 nt7□□□□□ -1.29
HCM1P25364 SUA5YGL169W 1281 nt7□□□□□ -1.29
HCM1P25364 YIP4YGL198W 708 nt7□□□□□ -1.29
HCM1P25364 MRP7YNL005C 1116 nt7□□□□□ -1.29
HCM1P25364 OCA1YNL099C 717 nt7□□□□□ -1.29
HCM1P25364 MRPS18YNL306W 654 nt7□□□□□ -1.29
HCM1P25364 ASR1YPR093C 867 nt7□□□□□ -1.29
HCM1P25364 YKR018CYKR018C 2178 nt7□□□□□ -1.29
HCM1P25364 MPE1YKL059C 1326 nt7□□□□□ -1.29
HCM1P25364 SIR2YDL042C 1689 nt7□□□□□ -1.29
HCM1P25364 MSB3YNL293W 1902 nt6.99□□□□□ -1.29
HCM1P25364 CCW12YLR110C 402 nt6.99□□□□□ -1.29
HCM1P25364 UBC12YLR306W 567 nt6.99□□□□□ -1.29
HCM1P25364 SAL1YNL083W 1485 nt6.98□□□□□ -1.29
HCM1P25364 GUT1YHL032C 2130 nt6.98□□□□□ -1.29
HCM1P25364 TFG2YGR005C 1203 nt6.98□□□□□ -1.29
HCM1P25364 ARC19YKL013C 516 nt6.98□□□□□ -1.29
HCM1P25364 YMR252CYMR252C 405 nt6.98□□□□□ -1.29
HCM1P25364 FSF1YOR271C 984 nt6.98□□□□□ -1.29
HCM1P25364 MRI1YPR118W 1236 nt6.98□□□□□ -1.29
HCM1P25364 PZF1YPR186C 1290 nt6.98□□□□□ -1.29
HCM1P25364 RRP9YPR137W 1722 nt6.98□□□□□ -1.29
HCM1P25364 TPO1YLL028W 1761 nt6.97□□□□□ -1.29
HCM1P25364 STF1YDL130W-A 261 nt6.97□□□□□ -1.29
HCM1P25364 YHR033WYHR033W 1272 nt6.97□□□□□ -1.29
HCM1P25364 RPL2BYIL018W 765 nt6.97□□□□□ -1.29
HCM1P25364 TAF9YMR236W 474 nt6.97□□□□□ -1.29
HCM1P25364 RNH201YNL072W 924 nt6.97□□□□□ -1.29
HCM1P25364 COQ3YOL096C 939 nt6.97□□□□□ -1.29
HCM1P25364 CMK2YOL016C 1344 nt6.97□□□□□ -1.29
HCM1P25364 RUP1YOR138C 2016 nt6.96□□□□□ -1.29
HCM1P25364 RMA1YKL132C 1293 nt6.96□□□□□ -1.3
HCM1P25364 YLR311CYLR311C 348 nt6.96□□□□□ -1.3
HCM1P25364 RTC4YNL254C 1206 nt6.96□□□□□ -1.3
HCM1P25364 HTZ1YOL012C 405 nt6.96□□□□□ -1.3
HCM1P25364 MMS21YEL019C 804 nt6.95□□□□□ -1.3
HCM1P25364 COA2YPL189C-A 207 nt6.95□□□□□ -1.3
HCM1P25364 AOS1YPR180W 1044 nt6.95□□□□□ -1.3
HCM1P25364 PEX28YHR150W 1740 nt6.95□□□□□ -1.3
HCM1P25364 CRH1YGR189C 1524 nt6.95□□□□□ -1.3
HCM1P25364 ASF1YJL115W 840 nt6.94□□□□□ -1.3
HCM1P25364 SED5YLR026C 1023 nt6.94□□□□□ -1.3
HCM1P25364 YNL092WYNL092W 1203 nt6.94□□□□□ -1.3
HCM1P25364 CTR1YPR124W 1221 nt6.94□□□□□ -1.3
HCM1P25364 GAT1YFL021W 1533 nt6.94□□□□□ -1.3
HCM1P25364 SEC24YIL109C 2781 nt6.94□□□□□ -1.3
HCM1P25364 OSW2YLR054C 2175 nt6.93□□□□□ -1.3
HCM1P25364 YER137CYER137C 447 nt6.93□□□□□ -1.3
HCM1P25364 HAM1YJR069C 594 nt6.93□□□□□ -1.3
HCM1P25364 FPR3YML074C 1236 nt6.93□□□□□ -1.3
HCM1P25364 YPR150WYPR150W 522 nt6.93□□□□□ -1.3
HCM1P25364 APE4YHR113W 1473 nt6.92□□□□□ -1.3
HCM1P25364 GCG1YER163C 699 nt6.92□□□□□ -1.3
HCM1P25364 ELP6YMR312W 822 nt6.92□□□□□ -1.3
HCM1P25364 AVL9YLR114C 2295 nt6.92□□□□□ -1.3
HCM1P25364 PRB1YEL060C 1908 nt6.91□□□□□ -1.3
HCM1P25364 PLB2YMR006C 2121 nt6.91□□□□□ -1.3
HCM1P25364 CKB1YGL019W 837 nt6.91□□□□□ -1.3
HCM1P25364 COX3Q0275 810 nt6.91□□□□□ -1.3
HCM1P25364 DAL80YKR034W 810 nt6.91□□□□□ -1.3
HCM1P25364 YLR361C-AYLR361C-A 297 nt6.91□□□□□ -1.3
HCM1P25364 YML018CYML018C 1182 nt6.91□□□□□ -1.3
HCM1P25364 RUF21RUF21 707 nt6.91□□□□□ -1.3
HCM1P25364 VPS28YPL065W 729 nt6.91□□□□□ -1.3
HCM1P25364 BDS1YOL164W 1941 nt6.9□□□□□ -1.3
HCM1P25364 ATP6Q0085 780 nt6.9□□□□□ -1.3
HCM1P25364 YER147C-AYER147C-A 411 nt6.9□□□□□ -1.3
HCM1P25364 FMO1YHR176W 1299 nt6.9□□□□□ -1.3
HCM1P25364 SNA3YJL151C 402 nt6.9□□□□□ -1.3
HCM1P25364 YPC1YBR183W 951 nt6.9□□□□□ -1.3
HCM1P25364 MAL31YBR298C 1845 nt6.9□□□□□ -1.31
HCM1P25364 RRP1YDR087C 837 nt6.89□□□□□ -1.31
HCM1P25364 YMR122CYMR122C 375 nt6.89□□□□□ -1.31
HCM1P25364 PEX27YOR193W 1131 nt6.89□□□□□ -1.31
HCM1P25364 CDC13YDL220C 2775 nt6.88□□□□□ -1.31
HCM1P25364 CDC1YDR182W 1476 nt6.88□□□□□ -1.31
HCM1P25364 Q0142Q0142 177 nt6.88□□□□□ -1.31
HCM1P25364 DIA1YMR316W 1011 nt6.88□□□□□ -1.31
HCM1P25364 IDP3YNL009W 1263 nt6.88□□□□□ -1.31
HCM1P25364 YNR005CYNR005C 405 nt6.88□□□□□ -1.31
HCM1P25364 LSC1YOR142W 990 nt6.88□□□□□ -1.31
HCM1P25364 MTC6YHR151C 1581 nt6.87□□□□□ -1.31
HCM1P25364 TOD6YBL054W 1578 nt6.87□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 11 ms