Protein–RNA interactions for Protein: P24864

CCNE1, G1/S-specific cyclin-E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE1P24864 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCNE1P24864 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCNE1P24864 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCNE1P24864 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCNE1P24864 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCNE1P24864 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCNE1P24864 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCNE1P24864 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCNE1P24864 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCNE1P24864 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCNE1P24864 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCNE1P24864 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCNE1P24864 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCNE1P24864 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCNE1P24864 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCNE1P24864 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CCNE1P24864 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCNE1P24864 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCNE1P24864 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CCNE1P24864 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCNE1P24864 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCNE1P24864 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCNE1P24864 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCNE1P24864 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCNE1P24864 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCNE1P24864 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCNE1P24864 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCNE1P24864 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCNE1P24864 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCNE1P24864 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCNE1P24864 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCNE1P24864 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCNE1P24864 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCNE1P24864 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCNE1P24864 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCNE1P24864 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCNE1P24864 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCNE1P24864 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCNE1P24864 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCNE1P24864 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCNE1P24864 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCNE1P24864 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCNE1P24864 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCNE1P24864 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CCNE1P24864 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCNE1P24864 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCNE1P24864 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCNE1P24864 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCNE1P24864 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCNE1P24864 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCNE1P24864 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCNE1P24864 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCNE1P24864 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCNE1P24864 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCNE1P24864 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCNE1P24864 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCNE1P24864 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCNE1P24864 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCNE1P24864 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCNE1P24864 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCNE1P24864 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCNE1P24864 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCNE1P24864 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCNE1P24864 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCNE1P24864 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCNE1P24864 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCNE1P24864 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCNE1P24864 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCNE1P24864 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CCNE1P24864 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCNE1P24864 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCNE1P24864 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CCNE1P24864 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCNE1P24864 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCNE1P24864 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCNE1P24864 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CCNE1P24864 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCNE1P24864 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCNE1P24864 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CCNE1P24864 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCNE1P24864 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCNE1P24864 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCNE1P24864 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCNE1P24864 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCNE1P24864 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCNE1P24864 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCNE1P24864 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCNE1P24864 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCNE1P24864 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCNE1P24864 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCNE1P24864 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCNE1P24864 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCNE1P24864 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCNE1P24864 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CCNE1P24864 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCNE1P24864 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCNE1P24864 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCNE1P24864 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCNE1P24864 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCNE1P24864 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms