Protein–RNA interactions for Protein: P21926

CD9, CD9 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD9P21926 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CD9P21926 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CD9P21926 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CD9P21926 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CD9P21926 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CD9P21926 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CD9P21926 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CD9P21926 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CD9P21926 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CD9P21926 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CD9P21926 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CD9P21926 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CD9P21926 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CD9P21926 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CD9P21926 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CD9P21926 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CD9P21926 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CD9P21926 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CD9P21926 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CD9P21926 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CD9P21926 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CD9P21926 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CD9P21926 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CD9P21926 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CD9P21926 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD9P21926 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD9P21926 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD9P21926 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD9P21926 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD9P21926 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD9P21926 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD9P21926 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD9P21926 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD9P21926 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD9P21926 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CD9P21926 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CD9P21926 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD9P21926 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD9P21926 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD9P21926 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD9P21926 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD9P21926 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD9P21926 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD9P21926 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD9P21926 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD9P21926 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD9P21926 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD9P21926 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD9P21926 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD9P21926 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD9P21926 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD9P21926 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD9P21926 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD9P21926 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD9P21926 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CD9P21926 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CD9P21926 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CD9P21926 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CD9P21926 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CD9P21926 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD9P21926 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CD9P21926 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD9P21926 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD9P21926 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CD9P21926 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD9P21926 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD9P21926 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD9P21926 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD9P21926 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD9P21926 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD9P21926 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD9P21926 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD9P21926 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD9P21926 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD9P21926 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD9P21926 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD9P21926 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD9P21926 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD9P21926 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD9P21926 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD9P21926 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD9P21926 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD9P21926 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD9P21926 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD9P21926 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD9P21926 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD9P21926 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD9P21926 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD9P21926 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD9P21926 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD9P21926 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD9P21926 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD9P21926 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD9P21926 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD9P21926 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD9P21926 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD9P21926 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD9P21926 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD9P21926 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD9P21926 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms