Protein–RNA interactions for Protein: P21281

ATP6V1B2, V-type proton ATPase subunit B, brain isoform, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1B2P21281 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP6V1B2P21281 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP6V1B2P21281 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP6V1B2P21281 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP6V1B2P21281 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP6V1B2P21281 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP6V1B2P21281 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP6V1B2P21281 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP6V1B2P21281 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP6V1B2P21281 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP6V1B2P21281 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP6V1B2P21281 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP6V1B2P21281 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP6V1B2P21281 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP6V1B2P21281 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP6V1B2P21281 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP6V1B2P21281 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP6V1B2P21281 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP6V1B2P21281 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP6V1B2P21281 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP6V1B2P21281 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP6V1B2P21281 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP6V1B2P21281 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP6V1B2P21281 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP6V1B2P21281 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP6V1B2P21281 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP6V1B2P21281 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP6V1B2P21281 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP6V1B2P21281 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP6V1B2P21281 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP6V1B2P21281 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP6V1B2P21281 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP6V1B2P21281 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP6V1B2P21281 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP6V1B2P21281 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP6V1B2P21281 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP6V1B2P21281 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP6V1B2P21281 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP6V1B2P21281 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP6V1B2P21281 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP6V1B2P21281 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP6V1B2P21281 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP6V1B2P21281 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP6V1B2P21281 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP6V1B2P21281 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP6V1B2P21281 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP6V1B2P21281 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP6V1B2P21281 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP6V1B2P21281 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP6V1B2P21281 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP6V1B2P21281 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP6V1B2P21281 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP6V1B2P21281 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP6V1B2P21281 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP6V1B2P21281 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP6V1B2P21281 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP6V1B2P21281 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP6V1B2P21281 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP6V1B2P21281 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP6V1B2P21281 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP6V1B2P21281 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP6V1B2P21281 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP6V1B2P21281 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP6V1B2P21281 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP6V1B2P21281 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP6V1B2P21281 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP6V1B2P21281 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP6V1B2P21281 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP6V1B2P21281 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP6V1B2P21281 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP6V1B2P21281 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP6V1B2P21281 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP6V1B2P21281 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP6V1B2P21281 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP6V1B2P21281 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP6V1B2P21281 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP6V1B2P21281 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP6V1B2P21281 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP6V1B2P21281 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP6V1B2P21281 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP6V1B2P21281 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP6V1B2P21281 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP6V1B2P21281 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP6V1B2P21281 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP6V1B2P21281 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP6V1B2P21281 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP6V1B2P21281 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP6V1B2P21281 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP6V1B2P21281 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP6V1B2P21281 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP6V1B2P21281 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP6V1B2P21281 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP6V1B2P21281 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP6V1B2P21281 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP6V1B2P21281 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP6V1B2P21281 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP6V1B2P21281 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP6V1B2P21281 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP6V1B2P21281 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP6V1B2P21281 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.5 ms