Protein–RNA interactions for Protein: P20393

NR1D1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D1P20393 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NR1D1P20393 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NR1D1P20393 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NR1D1P20393 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NR1D1P20393 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NR1D1P20393 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NR1D1P20393 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NR1D1P20393 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NR1D1P20393 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NR1D1P20393 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NR1D1P20393 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NR1D1P20393 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NR1D1P20393 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NR1D1P20393 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NR1D1P20393 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NR1D1P20393 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NR1D1P20393 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NR1D1P20393 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NR1D1P20393 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NR1D1P20393 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NR1D1P20393 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NR1D1P20393 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NR1D1P20393 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NR1D1P20393 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NR1D1P20393 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NR1D1P20393 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NR1D1P20393 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NR1D1P20393 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NR1D1P20393 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NR1D1P20393 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NR1D1P20393 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NR1D1P20393 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NR1D1P20393 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NR1D1P20393 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NR1D1P20393 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NR1D1P20393 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NR1D1P20393 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NR1D1P20393 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NR1D1P20393 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NR1D1P20393 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NR1D1P20393 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NR1D1P20393 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NR1D1P20393 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NR1D1P20393 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NR1D1P20393 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NR1D1P20393 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NR1D1P20393 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NR1D1P20393 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NR1D1P20393 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NR1D1P20393 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NR1D1P20393 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NR1D1P20393 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NR1D1P20393 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NR1D1P20393 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NR1D1P20393 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NR1D1P20393 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NR1D1P20393 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NR1D1P20393 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NR1D1P20393 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NR1D1P20393 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NR1D1P20393 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NR1D1P20393 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NR1D1P20393 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NR1D1P20393 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NR1D1P20393 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NR1D1P20393 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NR1D1P20393 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NR1D1P20393 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NR1D1P20393 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NR1D1P20393 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NR1D1P20393 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NR1D1P20393 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NR1D1P20393 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NR1D1P20393 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NR1D1P20393 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NR1D1P20393 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NR1D1P20393 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NR1D1P20393 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NR1D1P20393 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NR1D1P20393 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NR1D1P20393 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NR1D1P20393 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NR1D1P20393 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NR1D1P20393 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NR1D1P20393 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NR1D1P20393 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NR1D1P20393 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NR1D1P20393 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NR1D1P20393 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NR1D1P20393 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NR1D1P20393 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NR1D1P20393 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NR1D1P20393 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NR1D1P20393 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NR1D1P20393 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NR1D1P20393 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NR1D1P20393 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NR1D1P20393 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NR1D1P20393 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NR1D1P20393 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms