Protein–RNA interactions for Protein: P19878

NCF2, Neutrophil cytosol factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF2P19878 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCF2P19878 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCF2P19878 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCF2P19878 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCF2P19878 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCF2P19878 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCF2P19878 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCF2P19878 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCF2P19878 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCF2P19878 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCF2P19878 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCF2P19878 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NCF2P19878 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCF2P19878 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCF2P19878 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCF2P19878 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCF2P19878 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCF2P19878 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCF2P19878 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCF2P19878 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCF2P19878 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCF2P19878 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCF2P19878 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCF2P19878 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCF2P19878 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCF2P19878 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NCF2P19878 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NCF2P19878 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCF2P19878 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCF2P19878 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCF2P19878 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCF2P19878 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCF2P19878 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NCF2P19878 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NCF2P19878 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCF2P19878 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCF2P19878 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCF2P19878 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCF2P19878 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCF2P19878 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCF2P19878 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCF2P19878 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCF2P19878 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCF2P19878 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCF2P19878 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCF2P19878 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCF2P19878 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCF2P19878 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCF2P19878 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCF2P19878 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NCF2P19878 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCF2P19878 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NCF2P19878 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCF2P19878 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCF2P19878 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCF2P19878 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCF2P19878 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCF2P19878 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCF2P19878 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCF2P19878 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCF2P19878 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCF2P19878 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCF2P19878 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCF2P19878 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCF2P19878 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCF2P19878 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCF2P19878 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCF2P19878 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NCF2P19878 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCF2P19878 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NCF2P19878 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NCF2P19878 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCF2P19878 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCF2P19878 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCF2P19878 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCF2P19878 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NCF2P19878 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NCF2P19878 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NCF2P19878 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NCF2P19878 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NCF2P19878 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCF2P19878 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCF2P19878 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCF2P19878 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCF2P19878 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCF2P19878 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCF2P19878 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NCF2P19878 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCF2P19878 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCF2P19878 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCF2P19878 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NCF2P19878 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NCF2P19878 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NCF2P19878 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NCF2P19878 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NCF2P19878 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NCF2P19878 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCF2P19878 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCF2P19878 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NCF2P19878 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms