Protein–RNA interactions for Protein: P19012

KRT15, Keratin, type I cytoskeletal 15, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT15P19012 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KRT15P19012 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KRT15P19012 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT15P19012 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT15P19012 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT15P19012 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT15P19012 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT15P19012 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT15P19012 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT15P19012 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT15P19012 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT15P19012 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT15P19012 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT15P19012 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT15P19012 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT15P19012 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT15P19012 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT15P19012 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT15P19012 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT15P19012 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT15P19012 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT15P19012 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT15P19012 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT15P19012 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT15P19012 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT15P19012 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT15P19012 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT15P19012 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT15P19012 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT15P19012 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT15P19012 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT15P19012 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT15P19012 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT15P19012 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT15P19012 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT15P19012 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
KRT15P19012 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT15P19012 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT15P19012 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT15P19012 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT15P19012 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT15P19012 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT15P19012 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT15P19012 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT15P19012 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT15P19012 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT15P19012 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT15P19012 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT15P19012 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT15P19012 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT15P19012 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT15P19012 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT15P19012 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT15P19012 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT15P19012 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT15P19012 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT15P19012 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT15P19012 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT15P19012 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT15P19012 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT15P19012 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT15P19012 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT15P19012 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT15P19012 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT15P19012 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT15P19012 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT15P19012 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT15P19012 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT15P19012 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT15P19012 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT15P19012 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT15P19012 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT15P19012 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT15P19012 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT15P19012 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT15P19012 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT15P19012 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT15P19012 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT15P19012 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT15P19012 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT15P19012 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT15P19012 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT15P19012 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT15P19012 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT15P19012 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT15P19012 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT15P19012 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT15P19012 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT15P19012 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT15P19012 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT15P19012 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT15P19012 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT15P19012 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT15P19012 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT15P19012 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT15P19012 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KRT15P19012 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT15P19012 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT15P19012 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT15P19012 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.8 ms