Protein–RNA interactions for Protein: P17540

CKMT2, Creatine kinase S-type, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKMT2P17540 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CKMT2P17540 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CKMT2P17540 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CKMT2P17540 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CKMT2P17540 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CKMT2P17540 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CKMT2P17540 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CKMT2P17540 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CKMT2P17540 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CKMT2P17540 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CKMT2P17540 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CKMT2P17540 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CKMT2P17540 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CKMT2P17540 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CKMT2P17540 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CKMT2P17540 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CKMT2P17540 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CKMT2P17540 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CKMT2P17540 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CKMT2P17540 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CKMT2P17540 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CKMT2P17540 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CKMT2P17540 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CKMT2P17540 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CKMT2P17540 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CKMT2P17540 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CKMT2P17540 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CKMT2P17540 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CKMT2P17540 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CKMT2P17540 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CKMT2P17540 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CKMT2P17540 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CKMT2P17540 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CKMT2P17540 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CKMT2P17540 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CKMT2P17540 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CKMT2P17540 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CKMT2P17540 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CKMT2P17540 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CKMT2P17540 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CKMT2P17540 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CKMT2P17540 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CKMT2P17540 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CKMT2P17540 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CKMT2P17540 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CKMT2P17540 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CKMT2P17540 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CKMT2P17540 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CKMT2P17540 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CKMT2P17540 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CKMT2P17540 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CKMT2P17540 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CKMT2P17540 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CKMT2P17540 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CKMT2P17540 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CKMT2P17540 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CKMT2P17540 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CKMT2P17540 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CKMT2P17540 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CKMT2P17540 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CKMT2P17540 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CKMT2P17540 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CKMT2P17540 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CKMT2P17540 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CKMT2P17540 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CKMT2P17540 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CKMT2P17540 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CKMT2P17540 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CKMT2P17540 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CKMT2P17540 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CKMT2P17540 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CKMT2P17540 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CKMT2P17540 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CKMT2P17540 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CKMT2P17540 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CKMT2P17540 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CKMT2P17540 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CKMT2P17540 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CKMT2P17540 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CKMT2P17540 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CKMT2P17540 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CKMT2P17540 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CKMT2P17540 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CKMT2P17540 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CKMT2P17540 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CKMT2P17540 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CKMT2P17540 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CKMT2P17540 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CKMT2P17540 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CKMT2P17540 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CKMT2P17540 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CKMT2P17540 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CKMT2P17540 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CKMT2P17540 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CKMT2P17540 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CKMT2P17540 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CKMT2P17540 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CKMT2P17540 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CKMT2P17540 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CKMT2P17540 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms