Protein–RNA interactions for Protein: P15923

TCF3, Transcription factor E2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF3P15923 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TCF3P15923 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TCF3P15923 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TCF3P15923 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TCF3P15923 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TCF3P15923 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TCF3P15923 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TCF3P15923 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TCF3P15923 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TCF3P15923 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TCF3P15923 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TCF3P15923 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TCF3P15923 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TCF3P15923 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TCF3P15923 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TCF3P15923 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TCF3P15923 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TCF3P15923 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TCF3P15923 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TCF3P15923 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TCF3P15923 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TCF3P15923 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TCF3P15923 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TCF3P15923 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TCF3P15923 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TCF3P15923 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TCF3P15923 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TCF3P15923 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TCF3P15923 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TCF3P15923 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TCF3P15923 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TCF3P15923 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TCF3P15923 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TCF3P15923 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TCF3P15923 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TCF3P15923 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TCF3P15923 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TCF3P15923 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TCF3P15923 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TCF3P15923 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TCF3P15923 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TCF3P15923 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TCF3P15923 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TCF3P15923 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TCF3P15923 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TCF3P15923 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TCF3P15923 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TCF3P15923 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TCF3P15923 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TCF3P15923 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TCF3P15923 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TCF3P15923 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TCF3P15923 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TCF3P15923 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TCF3P15923 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TCF3P15923 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TCF3P15923 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TCF3P15923 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TCF3P15923 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TCF3P15923 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TCF3P15923 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TCF3P15923 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TCF3P15923 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TCF3P15923 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TCF3P15923 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TCF3P15923 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TCF3P15923 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TCF3P15923 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TCF3P15923 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TCF3P15923 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TCF3P15923 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TCF3P15923 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TCF3P15923 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TCF3P15923 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TCF3P15923 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TCF3P15923 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TCF3P15923 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TCF3P15923 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TCF3P15923 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TCF3P15923 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TCF3P15923 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TCF3P15923 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TCF3P15923 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TCF3P15923 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TCF3P15923 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TCF3P15923 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TCF3P15923 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TCF3P15923 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TCF3P15923 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TCF3P15923 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TCF3P15923 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TCF3P15923 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TCF3P15923 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TCF3P15923 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TCF3P15923 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TCF3P15923 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TCF3P15923 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TCF3P15923 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TCF3P15923 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TCF3P15923 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms