Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NME1P15531 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NME1P15531 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NME1P15531 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NME1P15531 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NME1P15531 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NME1P15531 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NME1P15531 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NME1P15531 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NME1P15531 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NME1P15531 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NME1P15531 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NME1P15531 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NME1P15531 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NME1P15531 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NME1P15531 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NME1P15531 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NME1P15531 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NME1P15531 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NME1P15531 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NME1P15531 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NME1P15531 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NME1P15531 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NME1P15531 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NME1P15531 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NME1P15531 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NME1P15531 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NME1P15531 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NME1P15531 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NME1P15531 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NME1P15531 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NME1P15531 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NME1P15531 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NME1P15531 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NME1P15531 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NME1P15531 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NME1P15531 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NME1P15531 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NME1P15531 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NME1P15531 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NME1P15531 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NME1P15531 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NME1P15531 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NME1P15531 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NME1P15531 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NME1P15531 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NME1P15531 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NME1P15531 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NME1P15531 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NME1P15531 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NME1P15531 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NME1P15531 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NME1P15531 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NME1P15531 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NME1P15531 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NME1P15531 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NME1P15531 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NME1P15531 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NME1P15531 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NME1P15531 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NME1P15531 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NME1P15531 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NME1P15531 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NME1P15531 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NME1P15531 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NME1P15531 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NME1P15531 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NME1P15531 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NME1P15531 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NME1P15531 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NME1P15531 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NME1P15531 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NME1P15531 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NME1P15531 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NME1P15531 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NME1P15531 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NME1P15531 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NME1P15531 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NME1P15531 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NME1P15531 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NME1P15531 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NME1P15531 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NME1P15531 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NME1P15531 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NME1P15531 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NME1P15531 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NME1P15531 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NME1P15531 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NME1P15531 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NME1P15531 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NME1P15531 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NME1P15531 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NME1P15531 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NME1P15531 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NME1P15531 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NME1P15531 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NME1P15531 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NME1P15531 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NME1P15531 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NME1P15531 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms