Protein–RNA interactions for Protein: P14543

NID1, Nidogen-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NID1P14543 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NID1P14543 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NID1P14543 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NID1P14543 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NID1P14543 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NID1P14543 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NID1P14543 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NID1P14543 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NID1P14543 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NID1P14543 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NID1P14543 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NID1P14543 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NID1P14543 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NID1P14543 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NID1P14543 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NID1P14543 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NID1P14543 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NID1P14543 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NID1P14543 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NID1P14543 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NID1P14543 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NID1P14543 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NID1P14543 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NID1P14543 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NID1P14543 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NID1P14543 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NID1P14543 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NID1P14543 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NID1P14543 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NID1P14543 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NID1P14543 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NID1P14543 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NID1P14543 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NID1P14543 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NID1P14543 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NID1P14543 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NID1P14543 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NID1P14543 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NID1P14543 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NID1P14543 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NID1P14543 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NID1P14543 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NID1P14543 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NID1P14543 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NID1P14543 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NID1P14543 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NID1P14543 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NID1P14543 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NID1P14543 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NID1P14543 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NID1P14543 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NID1P14543 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NID1P14543 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NID1P14543 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NID1P14543 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NID1P14543 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NID1P14543 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NID1P14543 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NID1P14543 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NID1P14543 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NID1P14543 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NID1P14543 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NID1P14543 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NID1P14543 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NID1P14543 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NID1P14543 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NID1P14543 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NID1P14543 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NID1P14543 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NID1P14543 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NID1P14543 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NID1P14543 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NID1P14543 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NID1P14543 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NID1P14543 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NID1P14543 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NID1P14543 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NID1P14543 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NID1P14543 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NID1P14543 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NID1P14543 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NID1P14543 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NID1P14543 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NID1P14543 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NID1P14543 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NID1P14543 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NID1P14543 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NID1P14543 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NID1P14543 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NID1P14543 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NID1P14543 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NID1P14543 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NID1P14543 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NID1P14543 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NID1P14543 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
NID1P14543 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NID1P14543 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NID1P14543 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NID1P14543 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NID1P14543 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 200.8 ms