Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC130P13994 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC130P13994 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC130P13994 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC130P13994 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC130P13994 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC130P13994 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC130P13994 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC130P13994 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC130P13994 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC130P13994 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC130P13994 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC130P13994 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC130P13994 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC130P13994 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC130P13994 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC130P13994 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC130P13994 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC130P13994 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC130P13994 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC130P13994 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC130P13994 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC130P13994 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC130P13994 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC130P13994 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC130P13994 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC130P13994 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC130P13994 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC130P13994 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC130P13994 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC130P13994 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC130P13994 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC130P13994 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC130P13994 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC130P13994 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC130P13994 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC130P13994 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC130P13994 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC130P13994 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC130P13994 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC130P13994 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC130P13994 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC130P13994 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC130P13994 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC130P13994 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC130P13994 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC130P13994 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC130P13994 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC130P13994 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC130P13994 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC130P13994 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC130P13994 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC130P13994 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC130P13994 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC130P13994 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC130P13994 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC130P13994 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC130P13994 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC130P13994 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC130P13994 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC130P13994 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC130P13994 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC130P13994 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC130P13994 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC130P13994 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC130P13994 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC130P13994 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC130P13994 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC130P13994 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC130P13994 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC130P13994 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC130P13994 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC130P13994 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC130P13994 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC130P13994 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC130P13994 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC130P13994 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC130P13994 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC130P13994 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC130P13994 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC130P13994 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC130P13994 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC130P13994 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC130P13994 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC130P13994 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC130P13994 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC130P13994 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC130P13994 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC130P13994 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC130P13994 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC130P13994 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC130P13994 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC130P13994 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC130P13994 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC130P13994 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC130P13994 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC130P13994 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC130P13994 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC130P13994 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC130P13994 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms