Protein–RNA interactions for Protein: P13804

ETFA, Electron transfer flavoprotein subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFAP13804 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ETFAP13804 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ETFAP13804 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ETFAP13804 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ETFAP13804 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ETFAP13804 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ETFAP13804 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ETFAP13804 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ETFAP13804 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ETFAP13804 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ETFAP13804 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ETFAP13804 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ETFAP13804 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ETFAP13804 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ETFAP13804 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ETFAP13804 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ETFAP13804 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ETFAP13804 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ETFAP13804 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ETFAP13804 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ETFAP13804 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ETFAP13804 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ETFAP13804 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ETFAP13804 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ETFAP13804 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ETFAP13804 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ETFAP13804 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ETFAP13804 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ETFAP13804 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ETFAP13804 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ETFAP13804 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ETFAP13804 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ETFAP13804 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ETFAP13804 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ETFAP13804 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ETFAP13804 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ETFAP13804 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ETFAP13804 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ETFAP13804 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ETFAP13804 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ETFAP13804 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ETFAP13804 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ETFAP13804 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ETFAP13804 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ETFAP13804 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ETFAP13804 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ETFAP13804 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ETFAP13804 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ETFAP13804 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ETFAP13804 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ETFAP13804 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ETFAP13804 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ETFAP13804 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ETFAP13804 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ETFAP13804 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ETFAP13804 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ETFAP13804 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ETFAP13804 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ETFAP13804 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ETFAP13804 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ETFAP13804 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ETFAP13804 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ETFAP13804 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ETFAP13804 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ETFAP13804 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ETFAP13804 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ETFAP13804 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ETFAP13804 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ETFAP13804 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ETFAP13804 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ETFAP13804 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ETFAP13804 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ETFAP13804 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ETFAP13804 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ETFAP13804 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ETFAP13804 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ETFAP13804 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ETFAP13804 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ETFAP13804 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ETFAP13804 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ETFAP13804 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ETFAP13804 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ETFAP13804 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ETFAP13804 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ETFAP13804 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ETFAP13804 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ETFAP13804 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ETFAP13804 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ETFAP13804 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ETFAP13804 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ETFAP13804 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ETFAP13804 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ETFAP13804 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ETFAP13804 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ETFAP13804 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ETFAP13804 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ETFAP13804 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ETFAP13804 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ETFAP13804 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ETFAP13804 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 258.3 ms