Protein–RNA interactions for Protein: P13385

TDGF1, Teratocarcinoma-derived growth factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDGF1P13385 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TDGF1P13385 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TDGF1P13385 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TDGF1P13385 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TDGF1P13385 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TDGF1P13385 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TDGF1P13385 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TDGF1P13385 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TDGF1P13385 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TDGF1P13385 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TDGF1P13385 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TDGF1P13385 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TDGF1P13385 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TDGF1P13385 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TDGF1P13385 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TDGF1P13385 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TDGF1P13385 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TDGF1P13385 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TDGF1P13385 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TDGF1P13385 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TDGF1P13385 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TDGF1P13385 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TDGF1P13385 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TDGF1P13385 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TDGF1P13385 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TDGF1P13385 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TDGF1P13385 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TDGF1P13385 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TDGF1P13385 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TDGF1P13385 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TDGF1P13385 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TDGF1P13385 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TDGF1P13385 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TDGF1P13385 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TDGF1P13385 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TDGF1P13385 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TDGF1P13385 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TDGF1P13385 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TDGF1P13385 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TDGF1P13385 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TDGF1P13385 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TDGF1P13385 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TDGF1P13385 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TDGF1P13385 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TDGF1P13385 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TDGF1P13385 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TDGF1P13385 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TDGF1P13385 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TDGF1P13385 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TDGF1P13385 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TDGF1P13385 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TDGF1P13385 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TDGF1P13385 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TDGF1P13385 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TDGF1P13385 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TDGF1P13385 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TDGF1P13385 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TDGF1P13385 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TDGF1P13385 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TDGF1P13385 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TDGF1P13385 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TDGF1P13385 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TDGF1P13385 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TDGF1P13385 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TDGF1P13385 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TDGF1P13385 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TDGF1P13385 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TDGF1P13385 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TDGF1P13385 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TDGF1P13385 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TDGF1P13385 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TDGF1P13385 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TDGF1P13385 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TDGF1P13385 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TDGF1P13385 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TDGF1P13385 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TDGF1P13385 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TDGF1P13385 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TDGF1P13385 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TDGF1P13385 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TDGF1P13385 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TDGF1P13385 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TDGF1P13385 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TDGF1P13385 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TDGF1P13385 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TDGF1P13385 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TDGF1P13385 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TDGF1P13385 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TDGF1P13385 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TDGF1P13385 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TDGF1P13385 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TDGF1P13385 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TDGF1P13385 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TDGF1P13385 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TDGF1P13385 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TDGF1P13385 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TDGF1P13385 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TDGF1P13385 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TDGF1P13385 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TDGF1P13385 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms