Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ACTN1P12814 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ACTN1P12814 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ACTN1P12814 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ACTN1P12814 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ACTN1P12814 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ACTN1P12814 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ACTN1P12814 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ACTN1P12814 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ACTN1P12814 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ACTN1P12814 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ACTN1P12814 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ACTN1P12814 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ACTN1P12814 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ACTN1P12814 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ACTN1P12814 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ACTN1P12814 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ACTN1P12814 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ACTN1P12814 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ACTN1P12814 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ACTN1P12814 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ACTN1P12814 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ACTN1P12814 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ACTN1P12814 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ACTN1P12814 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ACTN1P12814 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ACTN1P12814 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ACTN1P12814 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ACTN1P12814 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ACTN1P12814 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ACTN1P12814 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ACTN1P12814 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
ACTN1P12814 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ACTN1P12814 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ACTN1P12814 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ACTN1P12814 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
ACTN1P12814 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ACTN1P12814 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ACTN1P12814 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ACTN1P12814 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ACTN1P12814 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ACTN1P12814 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ACTN1P12814 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ACTN1P12814 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ACTN1P12814 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ACTN1P12814 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ACTN1P12814 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ACTN1P12814 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ACTN1P12814 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ACTN1P12814 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ACTN1P12814 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ACTN1P12814 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ACTN1P12814 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ACTN1P12814 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ACTN1P12814 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ACTN1P12814 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ACTN1P12814 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ACTN1P12814 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ACTN1P12814 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ACTN1P12814 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ACTN1P12814 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ACTN1P12814 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ACTN1P12814 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ACTN1P12814 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ACTN1P12814 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ACTN1P12814 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ACTN1P12814 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ACTN1P12814 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ACTN1P12814 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ACTN1P12814 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ACTN1P12814 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ACTN1P12814 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ACTN1P12814 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ACTN1P12814 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ACTN1P12814 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ACTN1P12814 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ACTN1P12814 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ACTN1P12814 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ACTN1P12814 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ACTN1P12814 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ACTN1P12814 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ACTN1P12814 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ACTN1P12814 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ACTN1P12814 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ACTN1P12814 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ACTN1P12814 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ACTN1P12814 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ACTN1P12814 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ACTN1P12814 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ACTN1P12814 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
ACTN1P12814 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ACTN1P12814 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ACTN1P12814 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ACTN1P12814 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ACTN1P12814 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ACTN1P12814 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ACTN1P12814 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ACTN1P12814 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ACTN1P12814 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ACTN1P12814 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.5 ms