Protein–RNA interactions for Protein: P12107

COL11A1, Collagen alpha-1(XI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL11A1P12107 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
COL11A1P12107 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
COL11A1P12107 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
COL11A1P12107 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
COL11A1P12107 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
COL11A1P12107 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
COL11A1P12107 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
COL11A1P12107 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
COL11A1P12107 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
COL11A1P12107 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
COL11A1P12107 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
COL11A1P12107 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
COL11A1P12107 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
COL11A1P12107 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
COL11A1P12107 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
COL11A1P12107 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
COL11A1P12107 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
COL11A1P12107 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
COL11A1P12107 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
COL11A1P12107 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
COL11A1P12107 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
COL11A1P12107 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
COL11A1P12107 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
COL11A1P12107 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
COL11A1P12107 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
COL11A1P12107 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
COL11A1P12107 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
COL11A1P12107 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
COL11A1P12107 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
COL11A1P12107 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
COL11A1P12107 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
COL11A1P12107 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
COL11A1P12107 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
COL11A1P12107 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
COL11A1P12107 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
COL11A1P12107 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
COL11A1P12107 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
COL11A1P12107 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
COL11A1P12107 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
COL11A1P12107 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
COL11A1P12107 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
COL11A1P12107 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
COL11A1P12107 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
COL11A1P12107 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
COL11A1P12107 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
COL11A1P12107 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
COL11A1P12107 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
COL11A1P12107 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
COL11A1P12107 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
COL11A1P12107 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
COL11A1P12107 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
COL11A1P12107 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
COL11A1P12107 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
COL11A1P12107 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
COL11A1P12107 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
COL11A1P12107 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
COL11A1P12107 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
COL11A1P12107 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
COL11A1P12107 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
COL11A1P12107 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
COL11A1P12107 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
COL11A1P12107 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
COL11A1P12107 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
COL11A1P12107 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
COL11A1P12107 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
COL11A1P12107 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
COL11A1P12107 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
COL11A1P12107 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
COL11A1P12107 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
COL11A1P12107 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
COL11A1P12107 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
COL11A1P12107 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
COL11A1P12107 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
COL11A1P12107 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
COL11A1P12107 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
COL11A1P12107 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
COL11A1P12107 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
COL11A1P12107 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
COL11A1P12107 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
COL11A1P12107 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
COL11A1P12107 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
COL11A1P12107 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
COL11A1P12107 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
COL11A1P12107 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
COL11A1P12107 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
COL11A1P12107 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
COL11A1P12107 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
COL11A1P12107 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
COL11A1P12107 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
COL11A1P12107 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
COL11A1P12107 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
COL11A1P12107 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
COL11A1P12107 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
COL11A1P12107 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
COL11A1P12107 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
COL11A1P12107 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
COL11A1P12107 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
COL11A1P12107 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
COL11A1P12107 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
COL11A1P12107 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms