Protein–RNA interactions for Protein: P08397

HMBS, Porphobilinogen deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBSP08397 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HMBSP08397 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HMBSP08397 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HMBSP08397 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HMBSP08397 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HMBSP08397 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HMBSP08397 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HMBSP08397 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HMBSP08397 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HMBSP08397 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HMBSP08397 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HMBSP08397 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HMBSP08397 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
HMBSP08397 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
HMBSP08397 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HMBSP08397 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HMBSP08397 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HMBSP08397 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HMBSP08397 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HMBSP08397 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HMBSP08397 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HMBSP08397 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HMBSP08397 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HMBSP08397 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HMBSP08397 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HMBSP08397 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HMBSP08397 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HMBSP08397 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HMBSP08397 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HMBSP08397 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HMBSP08397 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HMBSP08397 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HMBSP08397 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HMBSP08397 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HMBSP08397 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HMBSP08397 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HMBSP08397 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HMBSP08397 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HMBSP08397 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
HMBSP08397 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HMBSP08397 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
HMBSP08397 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HMBSP08397 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HMBSP08397 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HMBSP08397 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HMBSP08397 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HMBSP08397 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
HMBSP08397 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HMBSP08397 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HMBSP08397 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HMBSP08397 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HMBSP08397 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HMBSP08397 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HMBSP08397 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HMBSP08397 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HMBSP08397 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HMBSP08397 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HMBSP08397 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HMBSP08397 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HMBSP08397 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HMBSP08397 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
HMBSP08397 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HMBSP08397 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HMBSP08397 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
HMBSP08397 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HMBSP08397 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HMBSP08397 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
HMBSP08397 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
HMBSP08397 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HMBSP08397 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HMBSP08397 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HMBSP08397 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HMBSP08397 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HMBSP08397 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HMBSP08397 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HMBSP08397 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HMBSP08397 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HMBSP08397 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HMBSP08397 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
HMBSP08397 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HMBSP08397 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HMBSP08397 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HMBSP08397 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HMBSP08397 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HMBSP08397 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HMBSP08397 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HMBSP08397 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HMBSP08397 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HMBSP08397 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HMBSP08397 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HMBSP08397 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HMBSP08397 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HMBSP08397 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HMBSP08397 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HMBSP08397 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HMBSP08397 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HMBSP08397 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HMBSP08397 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HMBSP08397 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HMBSP08397 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms