Protein–RNA interactions for Protein: P08047

SP1, Transcription factor Sp1, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP1P08047 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SP1P08047 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SP1P08047 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SP1P08047 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SP1P08047 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SP1P08047 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SP1P08047 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SP1P08047 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SP1P08047 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SP1P08047 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SP1P08047 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SP1P08047 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SP1P08047 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SP1P08047 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SP1P08047 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SP1P08047 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SP1P08047 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SP1P08047 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SP1P08047 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SP1P08047 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SP1P08047 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SP1P08047 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SP1P08047 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SP1P08047 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SP1P08047 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SP1P08047 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SP1P08047 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SP1P08047 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SP1P08047 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SP1P08047 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SP1P08047 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SP1P08047 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SP1P08047 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SP1P08047 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SP1P08047 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SP1P08047 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SP1P08047 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SP1P08047 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
SP1P08047 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SP1P08047 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SP1P08047 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SP1P08047 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SP1P08047 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SP1P08047 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SP1P08047 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SP1P08047 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SP1P08047 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SP1P08047 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SP1P08047 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SP1P08047 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SP1P08047 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SP1P08047 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SP1P08047 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SP1P08047 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SP1P08047 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SP1P08047 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SP1P08047 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SP1P08047 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SP1P08047 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SP1P08047 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SP1P08047 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SP1P08047 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SP1P08047 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SP1P08047 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SP1P08047 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SP1P08047 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SP1P08047 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SP1P08047 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SP1P08047 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SP1P08047 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SP1P08047 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SP1P08047 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SP1P08047 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SP1P08047 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SP1P08047 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SP1P08047 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SP1P08047 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SP1P08047 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SP1P08047 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SP1P08047 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SP1P08047 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SP1P08047 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SP1P08047 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SP1P08047 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SP1P08047 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SP1P08047 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SP1P08047 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SP1P08047 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SP1P08047 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SP1P08047 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SP1P08047 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SP1P08047 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SP1P08047 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SP1P08047 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SP1P08047 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SP1P08047 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SP1P08047 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SP1P08047 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SP1P08047 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SP1P08047 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms