Protein–RNA interactions for Protein: P06732

CKM, Creatine kinase M-type, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKMP06732 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CKMP06732 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CKMP06732 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CKMP06732 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CKMP06732 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CKMP06732 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CKMP06732 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CKMP06732 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CKMP06732 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CKMP06732 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CKMP06732 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CKMP06732 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CKMP06732 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CKMP06732 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CKMP06732 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CKMP06732 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CKMP06732 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CKMP06732 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CKMP06732 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CKMP06732 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CKMP06732 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CKMP06732 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CKMP06732 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CKMP06732 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CKMP06732 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CKMP06732 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CKMP06732 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CKMP06732 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CKMP06732 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CKMP06732 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CKMP06732 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CKMP06732 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CKMP06732 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CKMP06732 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CKMP06732 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CKMP06732 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CKMP06732 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CKMP06732 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CKMP06732 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CKMP06732 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CKMP06732 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CKMP06732 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CKMP06732 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CKMP06732 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CKMP06732 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CKMP06732 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CKMP06732 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CKMP06732 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CKMP06732 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CKMP06732 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CKMP06732 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CKMP06732 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CKMP06732 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CKMP06732 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CKMP06732 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CKMP06732 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CKMP06732 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CKMP06732 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CKMP06732 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CKMP06732 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CKMP06732 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CKMP06732 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CKMP06732 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CKMP06732 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CKMP06732 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CKMP06732 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CKMP06732 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CKMP06732 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CKMP06732 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CKMP06732 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
CKMP06732 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CKMP06732 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CKMP06732 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CKMP06732 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CKMP06732 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CKMP06732 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CKMP06732 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CKMP06732 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CKMP06732 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CKMP06732 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CKMP06732 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CKMP06732 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CKMP06732 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CKMP06732 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CKMP06732 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CKMP06732 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CKMP06732 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CKMP06732 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CKMP06732 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CKMP06732 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CKMP06732 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CKMP06732 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CKMP06732 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CKMP06732 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CKMP06732 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CKMP06732 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CKMP06732 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CKMP06732 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CKMP06732 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CKMP06732 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms