Protein–RNA interactions for Protein: P06401

PGR, Progesterone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGRP06401 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PGRP06401 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PGRP06401 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PGRP06401 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PGRP06401 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PGRP06401 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PGRP06401 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGRP06401 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGRP06401 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGRP06401 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGRP06401 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGRP06401 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGRP06401 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGRP06401 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGRP06401 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGRP06401 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGRP06401 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PGRP06401 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PGRP06401 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PGRP06401 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PGRP06401 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PGRP06401 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGRP06401 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGRP06401 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGRP06401 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGRP06401 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGRP06401 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGRP06401 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGRP06401 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGRP06401 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGRP06401 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGRP06401 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGRP06401 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGRP06401 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGRP06401 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGRP06401 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGRP06401 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGRP06401 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGRP06401 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGRP06401 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGRP06401 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGRP06401 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGRP06401 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGRP06401 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGRP06401 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGRP06401 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGRP06401 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGRP06401 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGRP06401 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGRP06401 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PGRP06401 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PGRP06401 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PGRP06401 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PGRP06401 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PGRP06401 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGRP06401 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGRP06401 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGRP06401 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGRP06401 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGRP06401 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGRP06401 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGRP06401 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGRP06401 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGRP06401 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGRP06401 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGRP06401 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGRP06401 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGRP06401 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGRP06401 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGRP06401 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGRP06401 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGRP06401 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGRP06401 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGRP06401 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGRP06401 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGRP06401 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGRP06401 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGRP06401 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PGRP06401 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGRP06401 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGRP06401 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGRP06401 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGRP06401 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGRP06401 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PGRP06401 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PGRP06401 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PGRP06401 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PGRP06401 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PGRP06401 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PGRP06401 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PGRP06401 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PGRP06401 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PGRP06401 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGRP06401 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGRP06401 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGRP06401 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGRP06401 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGRP06401 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGRP06401 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGRP06401 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms