Protein–RNA interactions for Protein: P02655

APOC2, Apolipoprotein C-II, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC2P02655 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
APOC2P02655 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
APOC2P02655 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
APOC2P02655 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
APOC2P02655 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
APOC2P02655 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
APOC2P02655 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
APOC2P02655 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
APOC2P02655 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
APOC2P02655 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
APOC2P02655 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
APOC2P02655 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
APOC2P02655 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
APOC2P02655 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
APOC2P02655 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
APOC2P02655 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
APOC2P02655 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
APOC2P02655 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
APOC2P02655 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
APOC2P02655 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOC2P02655 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOC2P02655 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOC2P02655 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOC2P02655 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOC2P02655 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOC2P02655 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOC2P02655 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
APOC2P02655 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOC2P02655 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
APOC2P02655 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOC2P02655 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOC2P02655 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
APOC2P02655 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
APOC2P02655 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
APOC2P02655 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
APOC2P02655 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
APOC2P02655 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
APOC2P02655 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
APOC2P02655 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
APOC2P02655 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
APOC2P02655 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
APOC2P02655 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
APOC2P02655 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
APOC2P02655 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
APOC2P02655 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
APOC2P02655 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
APOC2P02655 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
APOC2P02655 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
APOC2P02655 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
APOC2P02655 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
APOC2P02655 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
APOC2P02655 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
APOC2P02655 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
APOC2P02655 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
APOC2P02655 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
APOC2P02655 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
APOC2P02655 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
APOC2P02655 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
APOC2P02655 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APOC2P02655 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
APOC2P02655 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
APOC2P02655 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
APOC2P02655 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
APOC2P02655 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
APOC2P02655 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
APOC2P02655 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
APOC2P02655 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
APOC2P02655 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
APOC2P02655 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
APOC2P02655 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
APOC2P02655 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
APOC2P02655 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
APOC2P02655 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
APOC2P02655 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
APOC2P02655 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
APOC2P02655 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APOC2P02655 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APOC2P02655 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
APOC2P02655 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
APOC2P02655 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
APOC2P02655 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APOC2P02655 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOC2P02655 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOC2P02655 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOC2P02655 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOC2P02655 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOC2P02655 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
APOC2P02655 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
APOC2P02655 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
APOC2P02655 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
APOC2P02655 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
APOC2P02655 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
APOC2P02655 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
APOC2P02655 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
APOC2P02655 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
APOC2P02655 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
APOC2P02655 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
APOC2P02655 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
APOC2P02655 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
APOC2P02655 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms