Protein–RNA interactions for Protein: P01850

TRBC1, T-cell receptor beta-1 chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBC1P01850 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRBC1P01850 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRBC1P01850 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRBC1P01850 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRBC1P01850 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRBC1P01850 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRBC1P01850 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRBC1P01850 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRBC1P01850 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TRBC1P01850 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRBC1P01850 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRBC1P01850 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRBC1P01850 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRBC1P01850 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRBC1P01850 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRBC1P01850 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRBC1P01850 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRBC1P01850 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRBC1P01850 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRBC1P01850 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRBC1P01850 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRBC1P01850 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TRBC1P01850 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRBC1P01850 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRBC1P01850 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRBC1P01850 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRBC1P01850 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRBC1P01850 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRBC1P01850 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRBC1P01850 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TRBC1P01850 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRBC1P01850 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRBC1P01850 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRBC1P01850 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TRBC1P01850 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRBC1P01850 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRBC1P01850 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRBC1P01850 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRBC1P01850 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRBC1P01850 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRBC1P01850 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRBC1P01850 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRBC1P01850 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRBC1P01850 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRBC1P01850 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRBC1P01850 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRBC1P01850 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRBC1P01850 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRBC1P01850 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRBC1P01850 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRBC1P01850 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRBC1P01850 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRBC1P01850 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRBC1P01850 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRBC1P01850 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRBC1P01850 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRBC1P01850 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRBC1P01850 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRBC1P01850 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRBC1P01850 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRBC1P01850 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRBC1P01850 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRBC1P01850 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRBC1P01850 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRBC1P01850 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TRBC1P01850 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRBC1P01850 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
TRBC1P01850 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TRBC1P01850 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRBC1P01850 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRBC1P01850 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRBC1P01850 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRBC1P01850 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRBC1P01850 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRBC1P01850 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRBC1P01850 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRBC1P01850 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRBC1P01850 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRBC1P01850 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRBC1P01850 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRBC1P01850 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TRBC1P01850 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRBC1P01850 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRBC1P01850 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRBC1P01850 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRBC1P01850 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRBC1P01850 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRBC1P01850 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRBC1P01850 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRBC1P01850 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRBC1P01850 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRBC1P01850 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRBC1P01850 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRBC1P01850 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRBC1P01850 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRBC1P01850 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TRBC1P01850 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TRBC1P01850 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRBC1P01850 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TRBC1P01850 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms