Protein–RNA interactions for Protein: P01133

EGF, Pro-epidermal growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFP01133 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EGFP01133 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
EGFP01133 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
EGFP01133 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
EGFP01133 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EGFP01133 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EGFP01133 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EGFP01133 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EGFP01133 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EGFP01133 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EGFP01133 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EGFP01133 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EGFP01133 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EGFP01133 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EGFP01133 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EGFP01133 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EGFP01133 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EGFP01133 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EGFP01133 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EGFP01133 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EGFP01133 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EGFP01133 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
EGFP01133 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EGFP01133 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EGFP01133 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EGFP01133 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EGFP01133 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EGFP01133 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EGFP01133 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EGFP01133 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EGFP01133 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EGFP01133 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
EGFP01133 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EGFP01133 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EGFP01133 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
EGFP01133 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EGFP01133 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EGFP01133 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EGFP01133 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EGFP01133 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EGFP01133 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EGFP01133 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EGFP01133 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EGFP01133 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EGFP01133 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EGFP01133 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
EGFP01133 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EGFP01133 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EGFP01133 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EGFP01133 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
EGFP01133 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
EGFP01133 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
EGFP01133 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EGFP01133 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EGFP01133 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EGFP01133 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EGFP01133 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EGFP01133 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EGFP01133 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EGFP01133 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EGFP01133 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EGFP01133 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EGFP01133 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EGFP01133 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EGFP01133 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EGFP01133 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EGFP01133 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EGFP01133 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
EGFP01133 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EGFP01133 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
EGFP01133 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EGFP01133 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
EGFP01133 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EGFP01133 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EGFP01133 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EGFP01133 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EGFP01133 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EGFP01133 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EGFP01133 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EGFP01133 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EGFP01133 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EGFP01133 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
EGFP01133 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EGFP01133 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EGFP01133 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EGFP01133 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EGFP01133 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EGFP01133 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EGFP01133 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EGFP01133 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EGFP01133 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EGFP01133 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EGFP01133 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EGFP01133 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EGFP01133 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EGFP01133 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EGFP01133 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
EGFP01133 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
EGFP01133 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EGFP01133 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms