Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POP4O95707 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POP4O95707 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POP4O95707 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POP4O95707 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POP4O95707 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POP4O95707 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POP4O95707 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
POP4O95707 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POP4O95707 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POP4O95707 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POP4O95707 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POP4O95707 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POP4O95707 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POP4O95707 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POP4O95707 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POP4O95707 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POP4O95707 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POP4O95707 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
POP4O95707 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POP4O95707 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POP4O95707 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
POP4O95707 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
POP4O95707 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POP4O95707 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POP4O95707 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
POP4O95707 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
POP4O95707 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POP4O95707 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
POP4O95707 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POP4O95707 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POP4O95707 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POP4O95707 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POP4O95707 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POP4O95707 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POP4O95707 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POP4O95707 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POP4O95707 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POP4O95707 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POP4O95707 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
POP4O95707 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POP4O95707 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POP4O95707 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
POP4O95707 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
POP4O95707 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
POP4O95707 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
POP4O95707 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
POP4O95707 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POP4O95707 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POP4O95707 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POP4O95707 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POP4O95707 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
POP4O95707 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POP4O95707 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POP4O95707 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
POP4O95707 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POP4O95707 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
POP4O95707 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POP4O95707 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POP4O95707 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POP4O95707 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POP4O95707 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POP4O95707 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
POP4O95707 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POP4O95707 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
POP4O95707 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
POP4O95707 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
POP4O95707 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
POP4O95707 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POP4O95707 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
POP4O95707 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POP4O95707 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POP4O95707 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POP4O95707 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POP4O95707 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POP4O95707 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POP4O95707 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POP4O95707 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POP4O95707 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POP4O95707 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POP4O95707 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POP4O95707 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POP4O95707 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
POP4O95707 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POP4O95707 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POP4O95707 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POP4O95707 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POP4O95707 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
POP4O95707 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POP4O95707 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
POP4O95707 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POP4O95707 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POP4O95707 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POP4O95707 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POP4O95707 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POP4O95707 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POP4O95707 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POP4O95707 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POP4O95707 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POP4O95707 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms