Protein–RNA interactions for Protein: O95377

GJB5, Gap junction beta-5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB5O95377 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GJB5O95377 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
GJB5O95377 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
GJB5O95377 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GJB5O95377 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
GJB5O95377 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GJB5O95377 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GJB5O95377 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
GJB5O95377 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GJB5O95377 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GJB5O95377 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27■■□□□ 1.91
GJB5O95377 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GJB5O95377 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GJB5O95377 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27■■□□□ 1.91
GJB5O95377 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
GJB5O95377 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GJB5O95377 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GJB5O95377 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GJB5O95377 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GJB5O95377 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GJB5O95377 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GJB5O95377 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GJB5O95377 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GJB5O95377 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GJB5O95377 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GJB5O95377 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GJB5O95377 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GJB5O95377 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
GJB5O95377 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GJB5O95377 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
GJB5O95377 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
GJB5O95377 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GJB5O95377 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GJB5O95377 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GJB5O95377 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GJB5O95377 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GJB5O95377 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GJB5O95377 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GJB5O95377 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
GJB5O95377 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GJB5O95377 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GJB5O95377 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GJB5O95377 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GJB5O95377 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
GJB5O95377 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GJB5O95377 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
GJB5O95377 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GJB5O95377 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GJB5O95377 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GJB5O95377 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GJB5O95377 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GJB5O95377 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
GJB5O95377 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GJB5O95377 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
GJB5O95377 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
GJB5O95377 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GJB5O95377 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GJB5O95377 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GJB5O95377 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GJB5O95377 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GJB5O95377 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
GJB5O95377 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GJB5O95377 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GJB5O95377 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
GJB5O95377 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GJB5O95377 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GJB5O95377 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GJB5O95377 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GJB5O95377 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GJB5O95377 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GJB5O95377 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GJB5O95377 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GJB5O95377 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GJB5O95377 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GJB5O95377 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GJB5O95377 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GJB5O95377 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GJB5O95377 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GJB5O95377 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GJB5O95377 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GJB5O95377 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GJB5O95377 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GJB5O95377 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GJB5O95377 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GJB5O95377 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GJB5O95377 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GJB5O95377 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GJB5O95377 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GJB5O95377 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GJB5O95377 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GJB5O95377 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GJB5O95377 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GJB5O95377 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GJB5O95377 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GJB5O95377 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GJB5O95377 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GJB5O95377 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GJB5O95377 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GJB5O95377 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GJB5O95377 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms