Protein–RNA interactions for Protein: O95239

KIF4A, Chromosome-associated kinesin KIF4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF4AO95239 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KIF4AO95239 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KIF4AO95239 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KIF4AO95239 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KIF4AO95239 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KIF4AO95239 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KIF4AO95239 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KIF4AO95239 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KIF4AO95239 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KIF4AO95239 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KIF4AO95239 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KIF4AO95239 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KIF4AO95239 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KIF4AO95239 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KIF4AO95239 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KIF4AO95239 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KIF4AO95239 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KIF4AO95239 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KIF4AO95239 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KIF4AO95239 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KIF4AO95239 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KIF4AO95239 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KIF4AO95239 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KIF4AO95239 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KIF4AO95239 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KIF4AO95239 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KIF4AO95239 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KIF4AO95239 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KIF4AO95239 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
KIF4AO95239 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KIF4AO95239 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KIF4AO95239 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KIF4AO95239 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KIF4AO95239 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KIF4AO95239 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KIF4AO95239 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KIF4AO95239 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KIF4AO95239 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KIF4AO95239 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KIF4AO95239 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KIF4AO95239 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KIF4AO95239 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KIF4AO95239 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KIF4AO95239 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KIF4AO95239 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KIF4AO95239 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KIF4AO95239 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KIF4AO95239 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KIF4AO95239 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KIF4AO95239 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KIF4AO95239 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KIF4AO95239 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KIF4AO95239 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
KIF4AO95239 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KIF4AO95239 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27■■□□□ 1.91
KIF4AO95239 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
KIF4AO95239 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27■■□□□ 1.91
KIF4AO95239 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KIF4AO95239 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KIF4AO95239 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KIF4AO95239 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KIF4AO95239 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KIF4AO95239 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
KIF4AO95239 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KIF4AO95239 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KIF4AO95239 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KIF4AO95239 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KIF4AO95239 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KIF4AO95239 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
KIF4AO95239 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KIF4AO95239 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KIF4AO95239 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KIF4AO95239 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KIF4AO95239 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KIF4AO95239 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KIF4AO95239 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KIF4AO95239 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KIF4AO95239 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
KIF4AO95239 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
KIF4AO95239 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KIF4AO95239 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
KIF4AO95239 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KIF4AO95239 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
KIF4AO95239 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KIF4AO95239 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KIF4AO95239 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KIF4AO95239 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KIF4AO95239 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KIF4AO95239 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KIF4AO95239 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KIF4AO95239 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KIF4AO95239 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KIF4AO95239 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KIF4AO95239 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KIF4AO95239 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KIF4AO95239 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
KIF4AO95239 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KIF4AO95239 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KIF4AO95239 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KIF4AO95239 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.2 ms