Protein–RNA interactions for Protein: O94955

RHOBTB3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBTB3O94955 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RHOBTB3O94955 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RHOBTB3O94955 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RHOBTB3O94955 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RHOBTB3O94955 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RHOBTB3O94955 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
RHOBTB3O94955 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RHOBTB3O94955 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RHOBTB3O94955 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RHOBTB3O94955 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RHOBTB3O94955 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RHOBTB3O94955 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RHOBTB3O94955 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RHOBTB3O94955 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RHOBTB3O94955 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RHOBTB3O94955 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RHOBTB3O94955 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RHOBTB3O94955 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RHOBTB3O94955 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RHOBTB3O94955 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
RHOBTB3O94955 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RHOBTB3O94955 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
RHOBTB3O94955 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RHOBTB3O94955 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RHOBTB3O94955 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RHOBTB3O94955 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RHOBTB3O94955 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RHOBTB3O94955 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RHOBTB3O94955 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RHOBTB3O94955 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RHOBTB3O94955 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RHOBTB3O94955 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RHOBTB3O94955 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RHOBTB3O94955 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RHOBTB3O94955 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RHOBTB3O94955 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RHOBTB3O94955 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RHOBTB3O94955 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RHOBTB3O94955 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RHOBTB3O94955 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RHOBTB3O94955 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RHOBTB3O94955 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RHOBTB3O94955 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RHOBTB3O94955 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RHOBTB3O94955 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RHOBTB3O94955 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RHOBTB3O94955 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RHOBTB3O94955 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RHOBTB3O94955 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RHOBTB3O94955 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RHOBTB3O94955 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RHOBTB3O94955 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RHOBTB3O94955 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RHOBTB3O94955 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RHOBTB3O94955 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RHOBTB3O94955 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
RHOBTB3O94955 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RHOBTB3O94955 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RHOBTB3O94955 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RHOBTB3O94955 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RHOBTB3O94955 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RHOBTB3O94955 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RHOBTB3O94955 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
RHOBTB3O94955 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
RHOBTB3O94955 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RHOBTB3O94955 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RHOBTB3O94955 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RHOBTB3O94955 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
RHOBTB3O94955 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
RHOBTB3O94955 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RHOBTB3O94955 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RHOBTB3O94955 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RHOBTB3O94955 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RHOBTB3O94955 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RHOBTB3O94955 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RHOBTB3O94955 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RHOBTB3O94955 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RHOBTB3O94955 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RHOBTB3O94955 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RHOBTB3O94955 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RHOBTB3O94955 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RHOBTB3O94955 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RHOBTB3O94955 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RHOBTB3O94955 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RHOBTB3O94955 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RHOBTB3O94955 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RHOBTB3O94955 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
RHOBTB3O94955 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RHOBTB3O94955 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RHOBTB3O94955 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RHOBTB3O94955 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RHOBTB3O94955 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RHOBTB3O94955 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RHOBTB3O94955 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RHOBTB3O94955 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RHOBTB3O94955 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RHOBTB3O94955 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RHOBTB3O94955 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RHOBTB3O94955 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RHOBTB3O94955 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms