Protein–RNA interactions for Protein: O75943

RAD17, Cell cycle checkpoint protein RAD17, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD17O75943 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
RAD17O75943 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
RAD17O75943 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
RAD17O75943 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
RAD17O75943 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
RAD17O75943 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RAD17O75943 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RAD17O75943 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RAD17O75943 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RAD17O75943 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RAD17O75943 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RAD17O75943 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RAD17O75943 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RAD17O75943 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
RAD17O75943 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RAD17O75943 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RAD17O75943 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RAD17O75943 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
RAD17O75943 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
RAD17O75943 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
RAD17O75943 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RAD17O75943 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RAD17O75943 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RAD17O75943 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RAD17O75943 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
RAD17O75943 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RAD17O75943 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
RAD17O75943 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
RAD17O75943 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RAD17O75943 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RAD17O75943 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RAD17O75943 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RAD17O75943 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RAD17O75943 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RAD17O75943 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RAD17O75943 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RAD17O75943 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
RAD17O75943 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
RAD17O75943 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
RAD17O75943 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
RAD17O75943 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
RAD17O75943 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RAD17O75943 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RAD17O75943 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RAD17O75943 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RAD17O75943 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
RAD17O75943 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
RAD17O75943 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RAD17O75943 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RAD17O75943 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
RAD17O75943 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
RAD17O75943 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
RAD17O75943 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
RAD17O75943 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RAD17O75943 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
RAD17O75943 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RAD17O75943 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
RAD17O75943 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RAD17O75943 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RAD17O75943 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
RAD17O75943 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RAD17O75943 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RAD17O75943 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
RAD17O75943 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RAD17O75943 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
RAD17O75943 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
RAD17O75943 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
RAD17O75943 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
RAD17O75943 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
RAD17O75943 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.14■■■□□ 2.41
RAD17O75943 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
RAD17O75943 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
RAD17O75943 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
RAD17O75943 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
RAD17O75943 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
RAD17O75943 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
RAD17O75943 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
RAD17O75943 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
RAD17O75943 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
RAD17O75943 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
RAD17O75943 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
RAD17O75943 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
RAD17O75943 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RAD17O75943 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
RAD17O75943 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
RAD17O75943 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
RAD17O75943 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
RAD17O75943 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
RAD17O75943 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
RAD17O75943 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RAD17O75943 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RAD17O75943 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RAD17O75943 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
RAD17O75943 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RAD17O75943 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RAD17O75943 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
RAD17O75943 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RAD17O75943 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
RAD17O75943 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
RAD17O75943 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 270.3 ms