Protein–RNA interactions for Protein: O75781

PALM, Paralemmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALMO75781 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PALMO75781 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PALMO75781 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PALMO75781 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PALMO75781 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PALMO75781 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PALMO75781 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PALMO75781 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PALMO75781 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PALMO75781 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PALMO75781 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PALMO75781 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PALMO75781 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PALMO75781 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PALMO75781 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PALMO75781 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PALMO75781 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PALMO75781 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PALMO75781 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PALMO75781 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PALMO75781 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PALMO75781 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PALMO75781 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PALMO75781 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PALMO75781 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PALMO75781 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PALMO75781 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PALMO75781 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PALMO75781 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PALMO75781 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PALMO75781 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PALMO75781 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PALMO75781 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PALMO75781 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PALMO75781 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PALMO75781 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PALMO75781 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PALMO75781 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PALMO75781 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PALMO75781 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PALMO75781 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PALMO75781 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PALMO75781 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PALMO75781 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PALMO75781 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PALMO75781 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PALMO75781 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PALMO75781 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PALMO75781 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PALMO75781 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PALMO75781 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PALMO75781 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PALMO75781 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PALMO75781 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PALMO75781 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PALMO75781 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PALMO75781 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PALMO75781 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PALMO75781 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PALMO75781 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PALMO75781 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PALMO75781 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PALMO75781 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PALMO75781 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PALMO75781 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PALMO75781 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PALMO75781 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PALMO75781 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PALMO75781 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PALMO75781 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PALMO75781 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PALMO75781 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PALMO75781 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PALMO75781 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PALMO75781 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PALMO75781 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PALMO75781 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PALMO75781 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PALMO75781 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PALMO75781 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PALMO75781 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PALMO75781 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PALMO75781 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PALMO75781 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PALMO75781 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PALMO75781 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PALMO75781 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PALMO75781 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PALMO75781 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PALMO75781 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PALMO75781 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PALMO75781 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PALMO75781 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PALMO75781 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PALMO75781 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PALMO75781 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PALMO75781 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PALMO75781 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PALMO75781 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PALMO75781 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms