Protein–RNA interactions for Protein: O75665

OFD1, Oral-facial-digital syndrome 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OFD1O75665 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
OFD1O75665 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
OFD1O75665 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
OFD1O75665 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
OFD1O75665 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
OFD1O75665 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
OFD1O75665 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
OFD1O75665 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
OFD1O75665 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
OFD1O75665 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
OFD1O75665 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
OFD1O75665 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
OFD1O75665 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
OFD1O75665 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
OFD1O75665 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
OFD1O75665 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
OFD1O75665 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
OFD1O75665 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
OFD1O75665 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
OFD1O75665 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
OFD1O75665 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
OFD1O75665 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
OFD1O75665 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
OFD1O75665 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
OFD1O75665 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
OFD1O75665 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
OFD1O75665 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
OFD1O75665 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
OFD1O75665 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
OFD1O75665 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
OFD1O75665 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
OFD1O75665 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
OFD1O75665 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
OFD1O75665 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
OFD1O75665 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
OFD1O75665 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
OFD1O75665 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
OFD1O75665 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
OFD1O75665 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
OFD1O75665 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
OFD1O75665 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
OFD1O75665 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
OFD1O75665 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
OFD1O75665 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
OFD1O75665 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
OFD1O75665 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
OFD1O75665 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
OFD1O75665 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
OFD1O75665 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
OFD1O75665 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
OFD1O75665 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
OFD1O75665 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
OFD1O75665 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
OFD1O75665 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
OFD1O75665 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
OFD1O75665 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
OFD1O75665 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
OFD1O75665 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
OFD1O75665 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
OFD1O75665 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
OFD1O75665 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
OFD1O75665 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
OFD1O75665 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
OFD1O75665 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
OFD1O75665 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
OFD1O75665 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
OFD1O75665 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
OFD1O75665 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
OFD1O75665 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
OFD1O75665 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
OFD1O75665 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
OFD1O75665 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
OFD1O75665 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
OFD1O75665 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
OFD1O75665 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
OFD1O75665 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
OFD1O75665 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
OFD1O75665 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
OFD1O75665 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
OFD1O75665 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
OFD1O75665 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
OFD1O75665 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
OFD1O75665 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
OFD1O75665 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
OFD1O75665 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
OFD1O75665 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
OFD1O75665 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
OFD1O75665 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
OFD1O75665 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
OFD1O75665 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
OFD1O75665 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
OFD1O75665 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
OFD1O75665 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
OFD1O75665 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
OFD1O75665 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
OFD1O75665 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
OFD1O75665 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
OFD1O75665 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
OFD1O75665 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
OFD1O75665 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms