Protein–RNA interactions for Protein: O75074

LRP3, Low-density lipoprotein receptor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP3O75074 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRP3O75074 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRP3O75074 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRP3O75074 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRP3O75074 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRP3O75074 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRP3O75074 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRP3O75074 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRP3O75074 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRP3O75074 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
LRP3O75074 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRP3O75074 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRP3O75074 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRP3O75074 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRP3O75074 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRP3O75074 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRP3O75074 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRP3O75074 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRP3O75074 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRP3O75074 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRP3O75074 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRP3O75074 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRP3O75074 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRP3O75074 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRP3O75074 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRP3O75074 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRP3O75074 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRP3O75074 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LRP3O75074 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LRP3O75074 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRP3O75074 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRP3O75074 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRP3O75074 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRP3O75074 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRP3O75074 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LRP3O75074 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRP3O75074 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRP3O75074 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRP3O75074 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRP3O75074 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRP3O75074 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LRP3O75074 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRP3O75074 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRP3O75074 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRP3O75074 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRP3O75074 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRP3O75074 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRP3O75074 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRP3O75074 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRP3O75074 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRP3O75074 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRP3O75074 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRP3O75074 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRP3O75074 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRP3O75074 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRP3O75074 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRP3O75074 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRP3O75074 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRP3O75074 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRP3O75074 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRP3O75074 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LRP3O75074 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRP3O75074 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRP3O75074 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRP3O75074 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRP3O75074 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRP3O75074 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRP3O75074 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRP3O75074 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRP3O75074 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRP3O75074 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRP3O75074 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRP3O75074 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRP3O75074 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRP3O75074 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LRP3O75074 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRP3O75074 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRP3O75074 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRP3O75074 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRP3O75074 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRP3O75074 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRP3O75074 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRP3O75074 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRP3O75074 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRP3O75074 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRP3O75074 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRP3O75074 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRP3O75074 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRP3O75074 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRP3O75074 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRP3O75074 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRP3O75074 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRP3O75074 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRP3O75074 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRP3O75074 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRP3O75074 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRP3O75074 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRP3O75074 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRP3O75074 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRP3O75074 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms