Protein–RNA interactions for Protein: O60682

MSC, Musculin, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSCO60682 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MSCO60682 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
MSCO60682 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MSCO60682 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MSCO60682 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MSCO60682 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MSCO60682 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MSCO60682 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MSCO60682 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MSCO60682 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MSCO60682 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MSCO60682 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MSCO60682 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
MSCO60682 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
MSCO60682 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MSCO60682 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
MSCO60682 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
MSCO60682 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MSCO60682 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MSCO60682 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MSCO60682 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MSCO60682 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MSCO60682 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MSCO60682 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MSCO60682 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MSCO60682 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
MSCO60682 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MSCO60682 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MSCO60682 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MSCO60682 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MSCO60682 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
MSCO60682 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MSCO60682 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MSCO60682 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MSCO60682 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MSCO60682 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
MSCO60682 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MSCO60682 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MSCO60682 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MSCO60682 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
MSCO60682 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MSCO60682 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
MSCO60682 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MSCO60682 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MSCO60682 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MSCO60682 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MSCO60682 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MSCO60682 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MSCO60682 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MSCO60682 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MSCO60682 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MSCO60682 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MSCO60682 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MSCO60682 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MSCO60682 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
MSCO60682 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MSCO60682 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MSCO60682 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MSCO60682 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MSCO60682 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MSCO60682 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MSCO60682 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
MSCO60682 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MSCO60682 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MSCO60682 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MSCO60682 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MSCO60682 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MSCO60682 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MSCO60682 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MSCO60682 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MSCO60682 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
MSCO60682 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MSCO60682 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MSCO60682 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MSCO60682 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MSCO60682 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
MSCO60682 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MSCO60682 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MSCO60682 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MSCO60682 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MSCO60682 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
MSCO60682 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MSCO60682 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MSCO60682 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MSCO60682 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MSCO60682 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MSCO60682 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MSCO60682 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MSCO60682 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MSCO60682 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MSCO60682 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MSCO60682 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
MSCO60682 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
MSCO60682 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MSCO60682 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MSCO60682 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MSCO60682 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MSCO60682 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
MSCO60682 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MSCO60682 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms