Protein–RNA interactions for Protein: O43896

KIF1C, Kinesin-like protein KIF1C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF1CO43896 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KIF1CO43896 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
KIF1CO43896 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KIF1CO43896 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KIF1CO43896 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KIF1CO43896 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KIF1CO43896 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KIF1CO43896 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KIF1CO43896 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KIF1CO43896 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KIF1CO43896 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KIF1CO43896 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KIF1CO43896 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KIF1CO43896 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
KIF1CO43896 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
KIF1CO43896 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KIF1CO43896 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KIF1CO43896 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KIF1CO43896 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KIF1CO43896 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KIF1CO43896 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KIF1CO43896 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KIF1CO43896 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KIF1CO43896 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KIF1CO43896 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
KIF1CO43896 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KIF1CO43896 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KIF1CO43896 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KIF1CO43896 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KIF1CO43896 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KIF1CO43896 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KIF1CO43896 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KIF1CO43896 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KIF1CO43896 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KIF1CO43896 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KIF1CO43896 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KIF1CO43896 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KIF1CO43896 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KIF1CO43896 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KIF1CO43896 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KIF1CO43896 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KIF1CO43896 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KIF1CO43896 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KIF1CO43896 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KIF1CO43896 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KIF1CO43896 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
KIF1CO43896 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KIF1CO43896 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KIF1CO43896 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KIF1CO43896 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KIF1CO43896 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KIF1CO43896 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KIF1CO43896 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KIF1CO43896 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KIF1CO43896 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KIF1CO43896 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KIF1CO43896 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KIF1CO43896 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KIF1CO43896 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KIF1CO43896 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KIF1CO43896 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KIF1CO43896 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KIF1CO43896 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KIF1CO43896 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KIF1CO43896 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KIF1CO43896 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KIF1CO43896 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KIF1CO43896 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KIF1CO43896 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KIF1CO43896 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KIF1CO43896 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KIF1CO43896 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KIF1CO43896 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KIF1CO43896 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KIF1CO43896 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KIF1CO43896 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KIF1CO43896 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KIF1CO43896 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KIF1CO43896 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KIF1CO43896 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KIF1CO43896 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KIF1CO43896 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KIF1CO43896 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KIF1CO43896 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KIF1CO43896 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KIF1CO43896 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIF1CO43896 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIF1CO43896 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIF1CO43896 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIF1CO43896 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIF1CO43896 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIF1CO43896 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIF1CO43896 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KIF1CO43896 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KIF1CO43896 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
KIF1CO43896 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KIF1CO43896 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
KIF1CO43896 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KIF1CO43896 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KIF1CO43896 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms