Protein–RNA interactions for Protein: O43812

DUX1, Double homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX1O43812 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
DUX1O43812 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DUX1O43812 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DUX1O43812 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DUX1O43812 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DUX1O43812 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DUX1O43812 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DUX1O43812 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DUX1O43812 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
DUX1O43812 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DUX1O43812 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DUX1O43812 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DUX1O43812 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DUX1O43812 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DUX1O43812 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
DUX1O43812 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DUX1O43812 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DUX1O43812 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DUX1O43812 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DUX1O43812 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DUX1O43812 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DUX1O43812 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DUX1O43812 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
DUX1O43812 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DUX1O43812 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DUX1O43812 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DUX1O43812 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DUX1O43812 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DUX1O43812 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DUX1O43812 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
DUX1O43812 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DUX1O43812 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DUX1O43812 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DUX1O43812 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
DUX1O43812 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DUX1O43812 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DUX1O43812 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DUX1O43812 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DUX1O43812 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DUX1O43812 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DUX1O43812 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DUX1O43812 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DUX1O43812 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DUX1O43812 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DUX1O43812 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DUX1O43812 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DUX1O43812 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DUX1O43812 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DUX1O43812 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DUX1O43812 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DUX1O43812 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DUX1O43812 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DUX1O43812 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DUX1O43812 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DUX1O43812 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DUX1O43812 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DUX1O43812 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DUX1O43812 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
DUX1O43812 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DUX1O43812 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DUX1O43812 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DUX1O43812 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DUX1O43812 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
DUX1O43812 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DUX1O43812 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DUX1O43812 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DUX1O43812 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DUX1O43812 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
DUX1O43812 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DUX1O43812 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DUX1O43812 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DUX1O43812 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
DUX1O43812 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DUX1O43812 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DUX1O43812 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DUX1O43812 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DUX1O43812 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DUX1O43812 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DUX1O43812 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DUX1O43812 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
DUX1O43812 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DUX1O43812 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DUX1O43812 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DUX1O43812 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DUX1O43812 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DUX1O43812 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DUX1O43812 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DUX1O43812 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DUX1O43812 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DUX1O43812 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DUX1O43812 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DUX1O43812 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DUX1O43812 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DUX1O43812 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DUX1O43812 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DUX1O43812 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
DUX1O43812 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DUX1O43812 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DUX1O43812 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DUX1O43812 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms