Protein–RNA interactions for Protein: O43707

ACTN4, Alpha-actinin-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4O43707 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ACTN4O43707 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ACTN4O43707 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ACTN4O43707 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
ACTN4O43707 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ACTN4O43707 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ACTN4O43707 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
ACTN4O43707 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
ACTN4O43707 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ACTN4O43707 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ACTN4O43707 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ACTN4O43707 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ACTN4O43707 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ACTN4O43707 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ACTN4O43707 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ACTN4O43707 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ACTN4O43707 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ACTN4O43707 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ACTN4O43707 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ACTN4O43707 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ACTN4O43707 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ACTN4O43707 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ACTN4O43707 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ACTN4O43707 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
ACTN4O43707 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ACTN4O43707 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ACTN4O43707 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ACTN4O43707 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ACTN4O43707 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ACTN4O43707 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ACTN4O43707 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ACTN4O43707 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ACTN4O43707 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ACTN4O43707 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ACTN4O43707 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ACTN4O43707 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ACTN4O43707 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ACTN4O43707 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ACTN4O43707 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ACTN4O43707 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ACTN4O43707 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
ACTN4O43707 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ACTN4O43707 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ACTN4O43707 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
ACTN4O43707 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ACTN4O43707 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ACTN4O43707 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ACTN4O43707 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ACTN4O43707 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ACTN4O43707 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ACTN4O43707 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
ACTN4O43707 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ACTN4O43707 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ACTN4O43707 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ACTN4O43707 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ACTN4O43707 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ACTN4O43707 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ACTN4O43707 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ACTN4O43707 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ACTN4O43707 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ACTN4O43707 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ACTN4O43707 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ACTN4O43707 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ACTN4O43707 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ACTN4O43707 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ACTN4O43707 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ACTN4O43707 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ACTN4O43707 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ACTN4O43707 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ACTN4O43707 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ACTN4O43707 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ACTN4O43707 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ACTN4O43707 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ACTN4O43707 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ACTN4O43707 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ACTN4O43707 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ACTN4O43707 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ACTN4O43707 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ACTN4O43707 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ACTN4O43707 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ACTN4O43707 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ACTN4O43707 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ACTN4O43707 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ACTN4O43707 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ACTN4O43707 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ACTN4O43707 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ACTN4O43707 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ACTN4O43707 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ACTN4O43707 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ACTN4O43707 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ACTN4O43707 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ACTN4O43707 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ACTN4O43707 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ACTN4O43707 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ACTN4O43707 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ACTN4O43707 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ACTN4O43707 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ACTN4O43707 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ACTN4O43707 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ACTN4O43707 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms