Protein–RNA interactions for Protein: O43633

CHMP2A, Charged multivesicular body protein 2a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP2AO43633 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHMP2AO43633 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHMP2AO43633 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHMP2AO43633 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHMP2AO43633 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHMP2AO43633 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHMP2AO43633 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHMP2AO43633 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHMP2AO43633 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHMP2AO43633 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHMP2AO43633 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHMP2AO43633 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHMP2AO43633 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHMP2AO43633 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHMP2AO43633 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHMP2AO43633 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHMP2AO43633 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHMP2AO43633 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHMP2AO43633 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHMP2AO43633 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHMP2AO43633 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHMP2AO43633 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHMP2AO43633 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHMP2AO43633 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHMP2AO43633 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHMP2AO43633 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHMP2AO43633 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHMP2AO43633 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHMP2AO43633 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHMP2AO43633 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHMP2AO43633 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHMP2AO43633 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CHMP2AO43633 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHMP2AO43633 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CHMP2AO43633 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHMP2AO43633 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHMP2AO43633 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHMP2AO43633 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHMP2AO43633 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHMP2AO43633 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHMP2AO43633 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHMP2AO43633 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHMP2AO43633 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHMP2AO43633 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHMP2AO43633 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHMP2AO43633 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHMP2AO43633 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHMP2AO43633 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHMP2AO43633 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CHMP2AO43633 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHMP2AO43633 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHMP2AO43633 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHMP2AO43633 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHMP2AO43633 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHMP2AO43633 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHMP2AO43633 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHMP2AO43633 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHMP2AO43633 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHMP2AO43633 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHMP2AO43633 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHMP2AO43633 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHMP2AO43633 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHMP2AO43633 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHMP2AO43633 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHMP2AO43633 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CHMP2AO43633 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHMP2AO43633 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHMP2AO43633 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHMP2AO43633 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHMP2AO43633 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
CHMP2AO43633 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHMP2AO43633 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHMP2AO43633 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHMP2AO43633 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHMP2AO43633 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHMP2AO43633 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHMP2AO43633 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHMP2AO43633 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHMP2AO43633 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHMP2AO43633 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHMP2AO43633 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHMP2AO43633 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHMP2AO43633 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHMP2AO43633 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHMP2AO43633 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHMP2AO43633 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHMP2AO43633 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHMP2AO43633 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHMP2AO43633 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHMP2AO43633 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHMP2AO43633 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CHMP2AO43633 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHMP2AO43633 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CHMP2AO43633 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHMP2AO43633 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHMP2AO43633 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHMP2AO43633 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHMP2AO43633 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHMP2AO43633 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHMP2AO43633 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms