Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNA1GO43497 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNA1GO43497 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNA1GO43497 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNA1GO43497 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNA1GO43497 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNA1GO43497 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNA1GO43497 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNA1GO43497 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNA1GO43497 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNA1GO43497 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNA1GO43497 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNA1GO43497 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNA1GO43497 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNA1GO43497 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNA1GO43497 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNA1GO43497 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNA1GO43497 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNA1GO43497 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNA1GO43497 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNA1GO43497 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNA1GO43497 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNA1GO43497 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNA1GO43497 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNA1GO43497 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNA1GO43497 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CACNA1GO43497 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CACNA1GO43497 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CACNA1GO43497 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CACNA1GO43497 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
CACNA1GO43497 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA1GO43497 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA1GO43497 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA1GO43497 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA1GO43497 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA1GO43497 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA1GO43497 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA1GO43497 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA1GO43497 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA1GO43497 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNA1GO43497 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNA1GO43497 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNA1GO43497 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNA1GO43497 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNA1GO43497 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNA1GO43497 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNA1GO43497 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNA1GO43497 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNA1GO43497 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNA1GO43497 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNA1GO43497 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNA1GO43497 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNA1GO43497 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNA1GO43497 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNA1GO43497 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNA1GO43497 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNA1GO43497 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNA1GO43497 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNA1GO43497 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA1GO43497 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA1GO43497 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA1GO43497 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA1GO43497 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA1GO43497 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA1GO43497 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA1GO43497 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA1GO43497 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA1GO43497 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA1GO43497 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA1GO43497 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA1GO43497 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA1GO43497 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA1GO43497 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNA1GO43497 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNA1GO43497 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNA1GO43497 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNA1GO43497 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNA1GO43497 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNA1GO43497 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNA1GO43497 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNA1GO43497 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNA1GO43497 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNA1GO43497 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNA1GO43497 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNA1GO43497 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNA1GO43497 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNA1GO43497 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNA1GO43497 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNA1GO43497 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA1GO43497 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA1GO43497 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA1GO43497 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA1GO43497 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNA1GO43497 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNA1GO43497 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNA1GO43497 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNA1GO43497 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNA1GO43497 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNA1GO43497 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNA1GO43497 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.2■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms